SCOP - Structural Classification Of Proteins Организована в соответствии со структурными семействами белков. Иерархическая система. - презентация

1 SCOP - Structural Classification Of Proteins Организована в соответствии со структурными семействами белков. Иерархическая система.

2 NCBI - Entrez Entrez - поисковая машина для баз NCBI. Поиск начинается с выбора адекватной области для поикса (Nucleotide, белки). Можно использовать определители полей, логические операторы, условия и т.д.

3 NCBI - Entrez Ограничения:

4 SRS ( Sequence Retrieval System). Исталлирована на множестве серверов. Имеет связи со многими базами данных. Предоставляет множество инструментов и служб для анализа. Позволяет сохранить результаты работы и анализа и продолжить работу локально.

5 SRS Рабочая среда Выбор базы данных Заполнение формы запроса Страница результатов

6 Текстовый поиск Общие принципы: 1.Все главные базы предоставляют удобные средства для тектового поиска. 2.Поиск по ключевым словам или полям. 3.Одновременный поиск в нескольких базах. 4.Дополнительные условия (дата, длина и т.д.).

7 Эффективность поиска Эффективность: время и адекватные результаты!

8 Проект ENCODE