Д.А. Равчеев (14 апреля 2009 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Трансмембранные белки. - презентация

1 Д.А. Равчеев (14 апреля 2009 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Трансмембранные белки

2 АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор

3 Объекты

4 -баррель -спирали

5

6 V.W.X.Y.Z

7 В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков белки с хотя бы одной трансмембранной спиралью Всего белковых структур. Мембранных 191 (0.6% )

8 В чем проблема?

9

10 von Heijne the positive-inside rule

11

12 К ак оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?

13 Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она потверждается. Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не потверждается. Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.