Структура РНК. Основные свойства 1. Одноцепочечная молекула 2. В клетке найдено множество типов РНК и каждый из них имеет специфичную функцию Основные. - презентация

1 Структура РНК

2 Основные свойства 1. Одноцепочечная молекула 2. В клетке найдено множество типов РНК и каждый из них имеет специфичную функцию Основные типы: рРНК, мРНК, тРНК Другие – рибозимы, регуляторные, праймеры, геномы вирусов,....

3 РНК и ДНК. РНК и ДНК.

4 Почему важна структура РНК? 1. Структура РНК определяет её функцию: А) Регуляторная Б) Структурная В) Каталитическая (рибозимы) 2. Некоторые вирусы имеют РНК геном (HIV,грипп)

5 Вторичная структура РНК.

6 Вторичная структура Петля (loop) Внутренняя Петля (Internal loop) Спираль, или стебель (stem) Мультипетля(junction) Выпетливание(Bulge) Псевдоузел(Pseudoknot)

7 Возможность предсказания вторичной структуры GGCGACUGGUGAGUACGCC

8 Расчёт энергии структуры по алгоритму Зукера UU Петля +5.9 Ккал/моль UU Петля +5.9 Ккал/моль A A A A G C Стэкинг+Пара –2*2.9 Ккал/моль G C Стэкинг+Пара –2*2.9 Ккал/моль G C G C A Выпетливание Ккал/моль A Выпетливание Ккал/моль G C Стекинг+Пара –1.8 Ккал/моль G C Стекинг+Пара –1.8 Ккал/моль U A -0.9 Ккал/моль U A -0.9 Ккал/моль A U -1.8 Ккал/моль A U -1.8 Ккал/моль C G -2.1Ккал/моль C G -2.1Ккал/моль A U 3 A U 3 A Неструктурированный 5` конец 0 Ккал/моль A Неструктурированный 5` конец 0 Ккал/мольA 5 G = -3.2 Ккал/моль G = -3.2 Ккал/моль

9 РНК, которые трудно предсказать алгоритмом Зукера РНК связанная с белками РНК связанная с белками Длинные РНК Длинные РНК Псевдоузлы Псевдоузлы

10 Вопросы?