Белок ДНК РНК. Белок Первичная структура – последовательность аминокислотных остатков Вторичная структура – спирали и листы Третичная структура – глобулярные, - презентация

1 Белок ДНК РНК

2 Белок Первичная структура – последовательность аминокислотных остатков Вторичная структура – спирали и листы Третичная структура – глобулярные, фибриллярные и мембранные белки Четвертичная структура - >1 цепи

3 Аминокислоты

4 Пептидная связь

5 Main-chain: N-C ) N-C ) (C -C) (C -C) Геометрия связи

6 strong repulsionstrong repulsion weak attraction weak attraction r 0 (N…N)=3.1A Карты Рамачадрана

7 GLYГлицин

8 ALA Аланин

9 >ALA: -atomsПрочие

10 ALA, etc. GLY only Эксперимент

11 Вторичные структуры

12 Helices: Right and Left H-bonds Спирали

13 Right -helix -helix Правая альфа-спираль

14 Вторичные структуры на картах Рамачадрана

15 Бета листы

16 ,twisted Закручивание бета-листов

17 ,twisted

18

19 -шпилька с поворотом -шпилька с поворотом

20 turn I turn II

21 -сгиб -сгиб

22 Тройная спираль коллагена

23 Secondary structure transitions We may consider only potential energy, etc.: E E COORD M M COORD S(E) S COORD (E COORD ) F(E) F COORD, etc.

24 Globular proteins Fibrous proteins H-bonds (NH:::OC) & hydrophobic forces Membraneproteins

25 >purH;Escherichia coli K-12 MG1655 MQQRRPVRRALLSVSDKAGIVEFAQALSARGVELLSTGGTARLLAEKGLPVTEVSDYTGF PEMMDGRVKTLHPKVHGGILGRRGQDDAIMEEHQIQPIDMVVVNLYPFAQTVAREGCSLE DAVENIDIGGPTMVRSAAKNHKDVAIVVKSSDYDAIIKEMDDNEGSLTLATRFDLAIKAF EHTAAYDSMIANYFGSMVPAYHGESKEAAGRFPRTLNLNFIKKLDMRYGENSHQQAAFYI EENVKEASVATATQVQGKALSYNNIADTDAALECVKEFAEPACVIVKHANPCGVAIGNSI LDAYDRAYKTDPTSAFGGIIAFNRELDAETAQAIISRQFVEVIIAPSASEEALKITAAKQ NVRVLTCGQWGERVPGLDFKRVNGGLLVQDRDLGMVGAEELRVVTKRQPSEQELRDALFC WKVAKFVKSNAIVYAKNNMTIGIGAGQMSRVYSAKIAGIKAADEGLEVKGSSMASDAFFP FRDGIDAAAAAGVTCVIQPGGSIRDDEVIAAADEHGIAMLFTDMRHFRH* >t3455;Salmonella enterica serovar Typhi Ty2 MQQRRPVRRALLSVSDKAGIIEFAQALSARGVELLSTGGTARLLAEKGLPVTEVSDYTGF PEMMDGRVKTLHPKVHGGILGRRGQDDAIMEQHHIAPIDMVVVNLYPFAETVAREGCSLA DAVENIDIGGPTMVRSAAKNHKDVAIVVKSSDYDAIIKEMDANEGSLTLDTRFDLAIKAF EHTAAYDSMIANYFGSMVPAYHGESKEAAGRFPRTLNLNFIKKQDMRYGENSHQQAAFYI EENVKEASVATAQQIQGKALSYNNIADTDAALECVKEFNEPACVIVKHANPCGVAVSTSI LDAYDRAYKTDPTSAFGGIIAFNRELDAETAQAIISRQFVEVLIAPSASEEALKITSAKQ NVRVLTCGQWASRVPGLDFKRVNGGLLVQDRDLGMVSEAELRVVSKRQPTEQELRDALFC WKVAKFVKSNAIVYAKENMTIGIGAGQMSRVYSAKIAGIKAADEGLEVKGSAMASDAFFP FRDGIDAAAAVGVSCVIQPGGSIRDDEVIAAADEHGIAMIFTDMRHFRH*Последовательность

26 ДНК

27

28

29 РНК

30 тРНК

31 Последовательность