Анализ аллельного полиморфизма; Анализ экспрессии генов; Исследование фрагментов нуклеиновых кислот и количественный анализ целевого фрагмента; Анализ. - презентация

1

2

3 Анализ аллельного полиморфизма; Анализ экспрессии генов; Исследование фрагментов нуклеиновых кислот и количественный анализ целевого фрагмента; Анализ системных и точечных мутаций; Генетическое сканирование (секвенирование); Анализ статуса метилирования ДНК; Сравнительное генотипирование; Атомно-эмиссионная спектрометрия с индуктивно связанной аргоновой плазмой (ИСП-АЭС); Масс-спектрометрия с индуктивно связанной аргоновой плазмой (ИСП-МС); Высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ); Определение молекулярно-генетических, эпигенетических и белковых маркеров предрасположенности к распространенным тяжелым патологиям человека и разработка неинвазивной диагностики на этой основе.

4 Секвенатор нового поколения ILLUMINA, работает по технологии кластеризации, «все в одной коробке», включая биоинформатику. Ресеквенирование Секвенирование Выявление редких вариантов Цифровое изображение картин экспрессии генов Определение транскриптов Секвенирование продуктов CHiP Mетиллирование Комплексное изучение генома человека и животных Исследование биомаркеров и их валидация Эпигенетические исследования Проведение клинических экспериментов Профиль экспрессии Поиск биомаркеров и их валидация Выявление ассоциированных заболеваний Диагностика сопутствующих заболеваний Стандартный скрининг Выявление инфекционных заболеваний

5 Геномный секвенатор нового поколения GS Junior, работает по технологии высокопроизводительного параллельного секвенирования, в основе которого лежит пиросеквенирования. Прямое, клональное секвенирование ампликонов; Таргетное ресеквенирование интересующих областей человеческого генома; De novo секвенирование микробных и вирусных геномов; Метагеномное исследование; Сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких соматических мутаций; Обнаружение минорных вариаций ВИЧ, вирусных гепатитов, гаплотипирование и др.

6 Высокопроизводительная чип-система QuantStudio 12K Flex с роботизированной станцией пробоподготовки Фрагментный анализ ДНК; SNP генетипирование; Мультиплексная детекция и анализ ; Цифровая ПЦР, количественная и качественная ПЦР реального времени; Изучение экспрессии генов; Плашки OpenArray, в которых более точек детекции.

7 Высокоэффективный жидкостной хроматограф Agilent 1260 в тандеме с времяпролетным масс спектрометром Agilent 6224 TOF Предназначен для анализа отдельных веществ в сложных смесях органических соединений – пищевых продуктах, объектах окружающей среды, физиологических жидкостях, фармацевтических препаратах, например, некоторые аминокислоты и липиды при болезнях обмена веществ.

8 Генетический анализатор ViiA7 Возможность выбора конфигурации термоблока: 96 лунок, 96 лунок для работы в скоростном режиме (96 Fast), 384 лунки и блок для проточных карт; Многоцветное детектирование – 6 фильтров эмиссии и 6 фильтров детекции сигнала (возможность проведения мультиплексных исследований); Способность детектировать 21 флуоресцентный краситель; ПЦР в скоростном режиме – за 40 мин (блок 96 Fast); Возможность независимого анализа кривых плавления ДНК и снятие полной кривой амплификации при типировании SNPs; Наличие жидкокристаллического дисплея с технологией TouchScreen; Программное обеспечение с наличием дополнительных подсказок.

9 Генетический анализатор 3500XL Секвенирование по методу Сенгера с целью поиска мутаций и SNP Целевое ресеквенирование интересующих областей генома Анализ микросателитных маркеров ДНК Идентификация личности Типирование микробных и вирусных геномов Мультиплексный анализ

10 Биоанализатор Agilent 2100 первый анализатор в мире, построенный на базе технологии lab-on-a-chip (лаборатория на чипе) усовершенствованный анализ нуклеиновых кислот, белков, и клеток На одной платформе проводится анализ: -ДНК, РНК (аналог электрофореза) - белков (аналог SDS-page) -клеток (аналог поточной цитофлуориметрии) Области применения: анализ фрагментов рестрикции ДНК; анализ продуктов ПЦР, определение генетически модифицированных организмов, установление родства; ранняя диагностика онкозаболеваний по теломеразе; количественное определение белков, определение уровня экспрессии генов

11 MagMAX Express-96, прибор для выделения и очистки нуклеиновых кислот методом магнитных частиц MagMAX Express-96 - способен одновременно обрабатывать до 96 образцов Выделяет сверхочищенные нуклеиновые кислоты Возможность кросс-контаминации сведена к нулю Полностью автоматизирован

12 LightCycler Nano, 100 канальный ПЦР-амплификатор Проведение высококачественного ПЦР анализов реальном времени, генотипирования и HRM-анализа; Гарантия проведения точной, воспроизводимой амплификации и анализа кривых плавления с применением специализированных флуоресцентных красителей и буферов. Использование самых современных форматов ПЦР-анализа для решения широкого круга задач. Анализ данных с помощью интуитивно понятного программного обеспечения, а также возможность автономной работы ПЦР- анализатора через USB-носитель.

13 ДНК концентратор CentriVap вакуумные концентраторы CentriVap сочетают в себе комбинацию центробежной силы, вакуума и нагрева для ускорения испарения образцов. Данная технология применима в молекулярной биологии, протеомике, геномике, клеточной биологии, микробиологии, биохимии, фармацевтике и аналитической химии. Cистемы CentriVap предназначены для пробоподготовки, концентрирования образцов объемом от нескольких микролитров до 25 мл, содержащих воду, кислоты, органические растворители.

14 Rotor-Gene Q (QIAGEN) Качественный ПЦР-анализ Выявление возбудителей широкого спектра инфекционных заболеваний Одновременное определение нескольких возбудителей в клиническом материале Генотипирование микроорганизмов Количественный ПЦР-анализ Определение вирусной нагрузки при инфекциях, вызванных ВИЧ, ВГС, ВГВ, ЦМВ и др. Определение концентрации генетически-модифицированных ингредиентов Оценка уровня экспрессии генов

15 Gel Doc XR+ Система гель- документирования Незаменима в тех случаях, когда требуются высокое разрешение или чувствительность при детекции хемилюминисцентных красителей или 2-D гелей высокого разрешения. Системы Gel Doc XR снабжена CCD камерами высокого разрешения. Детекция нуклеиновых кислот; Вестерн-блоттинг; 2-D электрофорез; Дот-блоттинг; Денситометрия; Подсчет числа колоний;

16 Бокс биологической безопасности АС2- 4Е1 «ESCO MICRO PTE LTD» Бокс абактериальной воздушной среды класса II (тип А) БАВНп-01 «Ламинар-С»-1,5 Предназначены для работы с биологическими агентами. Защищают оператора и окружающую среду во время работы с БА. Имеются HEPA и ULPA фильтры Соответствуют II классу биобезопасности

17 Иммуноферментный анализатор Evolis Twin Plus является полностью автоматизированной открытой системой использование одноразовых наконечников - гарантия отсутствия контаминации простота в обращении, понятный интерфейс несколько дублирующих систем проверки точности и правильности внесения образцов и реагентов возможность совмещения однотипных методик на одном планшете возможность использования первичных флаконов с реагентами Имеются стартовые наборы реагентов.

18 Мультиплексный анализатор Luminex 200 Требуются реактивы.

19 ПО ТРАНСЛЯЦИОННОЙ ЛАБОРАТОРИИ:

20 Цель: Внедрение инноваций и трансферта научных технологий медицинских наук в регионы РК через трансляционную лабораторию Клинико-экспериментальная лаборатория Операционный блок I, II Патоморфологическая лаборатория Клинико-экспериментальная лаборатория Операционный блок I, II Патоморфологическая лаборатория Виварий Лаборатория функциональных исследований

21

22 При проведении доклинических исследований необходимо его планирование. Особое внимание обращается на документы определяющие порядок проведения исследования, которые предусматривают: цель исследования; задачи исследования; методика отбора; дизайн проведения; регистрация результатов; статистическая обработка; выводы.

23 Согласно поставленным цели и задачам производится методика отбора (в конкретном случае проводится отбор животных по эксперименту: 1. доклинические исследования: острая, хроническая токсичность, эмбриотоксичность и т.д. 2. клинические исследования in vivo с продолжением клинического исследования на больных предусматривает: А) подача заявки на проведение данных работ на имя руководства НИИ, где полностью указывается название работы, научный консультант, дизайн исследования, срок эксперимента и объем биоматериала. Б) заполнение заборной карты (вид животного, количество) В) по окончании эксперимента акт списания животного, заполненного комиссионно- (научный консультагт, экспериментатор, лаборант). Все работы на животных выполняются с обязательным соблюдением Европейской конвенции защиты позвоночных животных, используемых для экспериментов и других научных целей (Страсбург, г.)

24 Заборная карта На получение животных и фуража кафедрой _____________________________________ за _______________ 2013 г. Уполномоченный от кафедры ____________________________________ (должность, Ф.И.О.) ДатаЕд.измСобакКроликовКрыс-БМышей-БЛягушекМ/свинкиРоспись

25 Патоморфологические исследования согласно целям и задачам научных исследований.

26 Цель : создание современного лабораторного технопарка, необходимого для подготовки высококвалифицированных специалистов, владеющих современными методами клинической лабораторной диагностики. Научно-образовательная лаборатория (НОЛ) ЛАБОРАТОРИЯ ОБЩЕКЛИНИЧЕСКИХ И БИОХИМИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛАБОРАТОРИЯ САНИТАРНО- ГИГИЕНИЧЕКСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛАБОРАТОРИЯ МОЛЕКУЛЯРНО- ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛАБОРАТОРИЯ СЕРОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАН МИНИЛАБОРАТОРИИ МОРФОЛОГИИ И ФИЗИОЛОГИИ ПРИ КАФЕДРЕ ГИСТОЛОГИИ И КАФЕДРЕ НОРМАЛЬНОЙ ФИЗИОЛОГИИ

27 ознакомление с лабораторным оборудованием и принципами лабораторных исследований студентов всех факультетов обучение методам лабораторной диагностики интернов, резидентов, докторантов и курсантов профильных кафедр ИПО Организация образовательного процесса для студентов на базе НОЛ совместно с кафедрами КаЗНМУ (гистология, микробиология, пат.физиология. клинико-лабораторная диагностика и др.) проведение студенческой научно-практической конференции Проведение научно-исследовательских студенческих работ применение современного лабораторного оборудования для общеклинических, биохимических, серологических и молекулярно-генетических исследований ; Определение молекулярно-генетических маркеров предрасположенности к распространенным мультифакторным заболеваниям. Развитие сотрудничества с подразделениями здравоохранения в области лабораторных исследований Оказание диагностической помощи населению на коммерческой основе Развитие международного сотрудничества Проведение семинаров, конференций, специализированных курсов, мастер-классов. Постоянное повышение квалификации сотрудников

28 Автоматический гематологический анализатор SYSMEX XS 1000i, Япония ОБЩЕКЛИНИЧЕСКИЕ И БИОХИМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ Экспресс - анализатор мочи URISYS 1100 Микроскоп Leica DM Четырехканальный коагулометр CoaData 4001 (HELENA BioSciences Europe) В лаборатории имеется автоматический гематологический анализатор Sysmex XS 1000i – 24 гематологических параметра; Экспресс - анализатор мочи URISYS 1100 для проведения общего анализа мочи; Четырехканальный коагулометр CoaData 4001 (HELENA BioSciences Europe) для определения в плазме крови основных параметров гемостаза; Микроскоп Leica DM для изучения морфологии форменных элементов крови.

29 Специфические белки α 1-кислый гликопротеин α 1-антитрепсин Альбумин (immuno.) Аполипопротеин А (APO A1 Аполипопротеин В (APO B) Антистрептолизина О (ASLO) C3c C4 Церулоплазмин С-реактивный белок (CRP) С-реактивный белок высокочувствительный Цистатин Ферритин Гаптоглобин Гликированный гемоглобин HbA1c Иммуноглобулин А (IgA) Иммуноглобулин G (IgG) Иммуноглобулин М (IgM) Kappa Light Chain Lambda Light Chain Липопротеин (а) Миоглобин Преальбумин Ревматоидный фактор (RF) Растворимые рецепторы трансферина Трансферрин Субстраты Альбумин Общий белок Билирубин общий Билирубин прямой Глюкоза Железо ЛЖСС Кальций Креатинин энз. метод Креатинин Яффе Лактат Магний Мочевая кислота Мочевина Фосфор Фруктозамин Триглицериды Xолестерин Холестерин ЛПВП Холестерин ЛПНП Ферменты Щелочная фосфатаза (ALP) АЛТ (ALT/GPT) Амилаза общая Панкреатическая амилаза АСТ (AST/GOT) Холинэстераза (CHE) Креатинкиназа (CK) Креатинкиназа MB (CK- MB) Гамма-ГТ (GGT) ЛДГ (LDH) Липаза Лекарственный мониторинг Ацетаминофен Амикацин Карбамазепин Циклоспорин А Дигитоксин Дигоксин Гентамицин Лидокаин Литий MPA NAPA Фенобарбитал Фенитоин Прокаинамид Хинидин Салицилат Теофиллин Тобрамицин Вальпроевая кислота Ванкомицин Другие тесты Антитромбин III Д-димер Тироксин (T4) Автоматический биохимический анализатор Cobas Integra 400 plus, «Roche Diagnostics», Швейцария ОБЩЕКЛИНИЧЕСКИЕ И БИОХИМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

30 Система для ЭХЛ анализа ELECSYS-2010, «Roche Diagnostics», Швейцария Онкология AFP HCG+β CEA CA 72-4 total PSA free PSA TG CA 15-3 CA 125 CA 19-9 Cyfra 21-1 NSE S100 Ferritin Костный обмен PTH PTH (STAT) PTH biointact* N-MID Osteocalcin β-CrossLaps Vitamin D3 (25-OH) P1NP Гормоны FSH LH Prolactin Estradiol Progesteronе Testosteronе SHBG Insulin C-Peptide DHEA-S Cortisol ACTH Беременность AFP HCG (STAT) HCG+β free β – HCG PAPP–A Кардиология CK-MB mass CK-MB mass (STAT) proBNP Digoxin Digitoxin Myoglobin Myoglobin (STAT) Troponin T Troponin T (STAT) Troponin T Hs Troponin T Hs (STAT) Анемия Ferritin Serum Folatе Vitamin B12 Cепсис PCT IL-6 Ревматоидный артрит Anti-CCP Повреждения мозга S100 Атопии Ig E Щитовидная железа TSH T3 FT3 T4 FT4 T-Uptake TG Anti-TG Anti-TPO Anti-TSHr Инфекционные болезни HВsAg, HBsAg II HВsAg (quantif.)* HBsAg conf. HBeAg Anti-HBs Anti-HBe Anti-HBc Anti-HBc IgM Anti-HAV Anti-HAV IgM AntiβHCV HIV combi HIV Ag HIV Ag conf. Toxo IgG Toxo avidity* Toxo IgM Rubella IgG Rubella IgM CMV IgG CMV IgM ОБЩЕКЛИНИЧЕСКИЕ И БИОХИМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ Предназначен как для количественных, так и для качественных in vitro измерений. Пропускная способность 85 тестов в час.

31 СЕРОЛОГИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ Иммунологические анализаторы: Tecan Sunrise – полуавтоматическ ий анализатор. Проточный цитофлуориметр Epics XL Использование полного спектра оборудования позволит проводить полноценные исследования для создания учебных и научных программ. Иммуноферментный анализатор Stat Fax, «Awareness inc.», Австрия Иммуноферментный анализатор Tecan, «Sunrise», Австрия Проточный цитофлуориметр Epics XL, «Beckman Coulter», США

32 При проведении научных исследований в НИИ возможны мастер-классы по обучению фрагментов научных исследований в зависимости от целей, задач, профиля выбранных студентами, резидентами, магистрантами. Додипломное и последипломное обучение методам современных лабораторных исследований на базе НОЛ Разработка учебных программ для студентов, интернов и курсантов профильных кафедр ИПО. Проведение лабораторных исследований в рамках совместной работы с подразделениями здравоохранения и оказания диагностической помощи населению. Проведение семинаров, конференций, специализированных курсов с целью повышения квалификации сотрудников и специалистов других учреждений на коммерческой основе. Организация и проведение научных студенческих конференций.

33 Ведутся переговоры о сотрудничестве по совместным проектам Ariel university center of Samaria (The State of Israel) Университет Перуджа Синьцзяньский Медицинский Университет Литовский Университет наук о здоровье НИИ психического здоровья Сибирского отделения (РАМН) Сибирский Государственный медицинский университет Белорусский Государственный Медицинский Университет Ереванский Государственный Медицинский Университет им. Мхитара Гераци Университет Нагасаки, Япония США, штат Флорида, Университет Южной Флориды. г.Тампа Международное сотрудничество