Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, 384-394, 2006. - презентация

1 Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, , 2006.

2 пароль для архива со статьями

3 Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! гомология = невынужденное сходство иерархичность распределения признаков

4 бинарные признаки (для простоты) дивергентная эволюция vs. гомоплазия Т.: все сочетания бинарных признаков нельзя получить только дивергентной эволюцией Т. о попарной совместимости: дивергентная эволюция ведет только к иерархическому распределению (без конфликтов) Если признаков и видов много, а эволюции нет, то конфликты - норма Иерархичность

5 хорда => инвертир. глаза => челюсти => 4 ноги и легкие => амнион => шерсть и молоко бедные иерархии: птицы – клювы, нет зубов, перья, нет молока, эритроциты с ядрами, правая дуга аорты; млекопит. – наоборот. морские млекопитающие – только хищники и копытные Примеры иерархического распределения

6 Исаев Определитель жесткокрылых Среднего Поволжья 2002

7 Nikaido et al. PNAS 1999

8 Galili and Swanson PNAS 1991

9 кластеризация корень проблемы – напр. притяжение длинных ветвей наибольшая экономия если нет гомоплазий – ПРАВИЛЬНОЕ дерево Подходы к построению филогений

10 Nikaido et al. PNAS 1999

11 кластеризация корень проблемы – напр. притяжение длинных ветвей наибольшая экономия если нет гомоплазий – ПРАВИЛЬНОЕ дерево конфликты обычно есть (млек.: 100 млн лет – насыщение) как укоренять? поляризация аутгруппы (древо жизни?) Подходы к построению филогений

12 W.F.Doolittle 2000 Sci Am

13

14 2001 Nature

15 Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

16 Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

17 Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

18 Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176

19 Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176 Kimura 2-parameter model

20 К след. лекции: