Лекция 2 ПОНЯТИЯ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ТАКСОНОМИИ
Строение аминокислот
Пептидная связь
Стандартные аминокислоты
Глицин GlyGGlycine Гли Аланин AlaAAlanine Ала Валин ValVValine Вал Изолейцин IleIIsoleucine Иле Лейцин LeuLLeucine Лей Пролин ProPProline Про Серин SerSSerine Сер Треонин ThrTThreonine Тре Цистеин CysCCysteine Цис Метионин MetMMethionine Мет Аспарагиновая кислота AspDasparDic acid Асп Аспарагин AsnNasparagiNe Асн Глутаминовая кислота GluEgluEtamic acid Глу Глутамин GlnQQ-tamine Глн Лизин LysKbefore L Лиз Аргинин ArgRaRginine Арг Гистидин HisHHistidine Гис Фенилаланин PheFFenylalanine Фен Тирозин TyrYtYrosine Тир Триптофан TrpWtWo rings Три
Строение нуклеотидов
Азотистые основания
Структура молекулы ДНК
Водородные связи
Направленность
Универсальный генетический код 2- е основание TCAG 1- е основание T TTT (Phe/F) Фенилаланин TTC (Phe/F) Фенилаланин TTA (LeT/L) Лейцин TTG (LeT/L) Лейцин TCT (Ser/S) Серин TCC (Ser/S) Серин TCA (Ser/S) Серин TCG (Ser/S) Серин TAT (Tyr/Y) Тирозин TAC (Tyr/Y) Тирозин TAA Стоп TAG Стоп TGT (Cys/C) Цистеин TGC (Cys/C) Цистеин TGA Стоп TGG (Trp/W) Триптофан C CTT (LeT/L) Лейцин CTC (LeT/L) Лейцин CTA (LeT/L) Лейцин CTG (LeT/L) Лейцин CCT (Pro/P) Пролин CCC (Pro/P) Пролин CCA (Pro/P) Пролин CCG (Pro/P) Пролин CAT (His/H) Гистидин CAC (His/H) Гистидин CAA (Gln/Q) Глутамин CAG (Gln/Q) Глутамин CGT (Arg/R) Аргинин CGC (Arg/R) Аргинин CGA (Arg/R) Аргинин CGG (Arg/R) Аргинин A ATT (Ile/I) Изолейцин ATC (Ile/I) Изолейцин ATA (Ile/I) Изолейцин ATG (Met/M) Метионин ACT (Thr/T) Треонин ACC (Thr/T) Треонин ACA (Thr/T) Треонин ACG (Thr/T) Треонин AAT (Asn/N) Аспарагин AAC (Asn/N) Аспарагин AAA (Lys/K) Лизин AAG (Lys/K) Лизин AGT (Ser/S) Серин AGC (Ser/S) Серин AGA (Arg/R) Аргинин AGG (Arg/R) Аргинин G GTT (Val/V) Валин GTC (Val/V) Валин GTA (Val/V) Валин GTG (Val/V) Валин GCT (Ala/A) Аланин GCC (Ala/A) Аланин GCA (Ala/A) Аланин GCG (Ala/A) Аланин GAT (Asp/D) Аспарагиновая кислота GAC (Asp/D) Аспарагиновая кислота GAA (GlT/E) Глутаминовая кислота GAG (GlT/E) Глутаминовая кислота GGT (Gly/G) Глицин GGC (Gly/G) Глицин GGA (Gly/G) Глицин GGG (Gly/G) Глицин
Обратная таблица Ala/AGCT, GCC, GCA, GCGLeT/LTTA, TTG, CTT, CTC, CTA, CTG Arg/RCGT, CGC, CGA, CGG, AGA, AGGLys/KAAA, AAG Asn/NAAT, AACMet/MATG Asp/DGAT, GACPhe/FTTT, TTC Cys/CTGT, TGCPro/PCCT, CCC, CCA, CCG Gln/QCAA, CAGSer/STCT, TCC, TCA, TCG, AGT, AGC GlT/EGAA, GAGThr/TACT, ACC, ACA, ACG Gly/GGGT, GGC, GGA, GGGTrp/WTGG His/HCAT, CACTyr/YTAT, TAC Ile/IATT, ATC, ATAVal/VGTT, GTC, GTA, GTG STOPTAG, TGA, TAA
Транзиции : A G С Т Трансверсии : А Т А С G T G С
Возможные типы нуклеотидных замен Типы замены Число замен % Всего во всех кодонах синонимичные не синонимичные изменяющие смысл нонсенс Всего во всех кодонах синонимичные не синонимичные изменяющие смысл нонсенс Всего во всех кодонах синонимичные не синонимичные изменяющие смысл нонсенс Всего во всех кодонах синонимичные не синонимичные изменяющие смысл нонсенс