РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ТРОПИЗМА ВИЧ-1 НА ЯМАЛЕ. Главный врач, заслуженный врач РФ, к.м.н. Л.Ю.Волова Ноябрьск 2014 г. ГБУЗ «Ямало-Ненецкий окружной Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями»
Выявление лекарственной резистентности у пациентов, находящихся на АРВТ Схемы АРВТКол-во пациентов на АРВТ Кол-во пациентов, у которых сформировалась резистентность Срок формирования резистентности: до 1 года Срок формирован ия резистентности: свыше 1 года НИОТ + ННИОТ НИОТ + ИП Всего
Частота формирования мутаций лекарственной резистентности к различным группам АРВП Группа АРВП Выявленная мутация Частота встречаемости мутации лекарственной резистентности (%) ННИОТK103N52,9 G190S35,3 Y188L5,9 V108I5,9 ВСЕГО100 НИОТM184V66 M184V+L74V16,8 K65R+Y11F5,6 V75S5,6 T69A5,6 ВСЕГО100 ИПL90M33,3 I50L33,3 M46I +G48V+ +L10I33,3 ВСЕГО100
Генетические разновидности ВИЧ-1, выявленные на территории ЯНАО
Соотношение Wt и Mut V77I среди новых случаев заражения при наркотическом пути передачи. Соотношение Wt и Mut V77I среди новых случаев заражения при половом пути передачи. Соотношение «дикого»(Wt) и мутантного«Mut V77I» (с заменой валина на изолейцин в 77 ом кодоне гена протеазы) штаммов среди новых случаев при наркотическом пути заражения Соотношение «дикого»(Wt) и мутантного«Mut V77I» (с заменой валина на изолейцин в 77 ом кодоне гена протеазы) штаммов среди новых случаев при половом пути заражения
14-ая Европейская конференция по ВИЧ 14th EUROPEAN AIDS CONFERENCE, October 2013, Brussels, Belgium,
Соотношение Х4- и R5- тропных вирусов в группах не-КМНС с различной давностью инфицирования. Соотношение Х4- и R5- тропных вирусов в группе КМНС с различной давностью инфицирования.
Применение филогенетического анализа при проведении эпидрасследований. Красным – выделены образцы, принадлежащие пациентам, задействованным в медицинской аварии в г. Новый Уренгой.
Применение филогенетического анализа при проведении эпидрасследований. Зеленым – выделены образцы пациентов их очага ВИЧ-инфекции
Применение результатов молекулярно- эпидемиологического мониторинга при проведении эпидемиологических расследований. Расшифровка эпидочага по результатам эпиданамнеза Расшифровка эпидочага по результатам молекулярно- эпидемиологического мониторинга 1. Случай медицинской аварии в г. Новый Уренгой. 2. Расшифровка эпидочага в г. Губкинский. 3. Расшифровка эпидочага в г. Салехарде.
При сборе эпиданамнеза врач-травматолог указал на профессиональные ситуации, произошедшие в течение истекшего года, в которых он оказывал неотложную медицинскую помощь ВИЧ- инфицированным пациентам 1 и 2. С целью подтверждения профессионального заражения проведен сравнительный молекулярно- биологический и филогенетический анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей штаммов ВИЧ-1 у предполагаемых источников заражения и потерпевшего. Установление источника заражения врача-травматолога в ГБУЗ ЯНАО «N *** больница» 1 декабря 2011 года при прохождении ежегодного медицинского осмотра у врача-травматолога были обнаружены антитела к ВИЧ-1. В последствии лабораторный диагноз ВИЧ-инфекции подтвержден в реакции иммунного блота.
Молекулярно-биологический и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена pol ВИЧ-1 проиллюстрирован рисунком 1, откуда видно, что штаммы пациентов – предполагаемых источников заражения образуют общую филогенетическую ветвь со стандартным штаммом подтипа А ВИЧ-1 из Gen Bank. Штамм «потерпевшего» кластеризуется со стандартным штаммом подтипа В ВИЧ-1 из Gen Bank. Применение филогенетического анализа для установления источника заражения врача-травматолога. Красным – выделены образцы, принадлежащие к ВИЧ-1 подтипа А; зеленым – выделен образец, принадлежащий к подтипу В.
При анализе полученных нуклеотидных последовательностей гена pol ВИЧ-1 (1302 пары нуклеотидов в формате «fasta») в программе REGA HIV-1 Subtyping Tool (версия 2), представленной на сайте Стенфордского университета ( [1], также установлено, что штамм потерпевшего принадлежит к ВИЧ-1 подтипа В, в то время как штаммы предполагаемых источников заражения относятся к подтипу А. Таким образом, прямое филогенетическое родство между исследуемыми штаммами отсутствует, что полностью исключает вариант профессионального заражения, указанный врачом-травматологом.
Выводы: 1. Впервые в России на уровне учреждения практического здравоохранения внедрен метод молекулярно-эпидемиологического мониторинга ВИЧ- инфекции, использующий лабораторные данные о структуре гена pol ВИЧ Показана целесообразность и эффективность применения результатов секвенирования гена pol ВИЧ-1 с целью объективного установления источника заражения и эпидемических связей при проведении эпидемиологических расследований.
Выводы: 3. В проведенном нами исследовании установлено, что частота выявления CXCR4-тропных вариантов ВИЧ- 1 была наибольшей у пациентов на ранних сроках инфицирования (до 1 года) и уменьшалась по мере увеличения давности инфицирования. 4. Необходимо углубленное изучение особенностей циркуляции CXCR4/ CCR5-тропных вариантов ВИЧ-1 в популяции КМНС с целью прогнозирования ситуации и управления эпидемией ВИЧ в среде КМНС.
СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!