Анализ роли мотива ArgH52–GluH61 в связывании антигенов антителами Презентацию подготовил ученик 10 Н класса СУНЦ МГУ Петров Артем под руководством О.В.Колясникова и В.К.Аржаника
Общее строение антитела
Аминокислотные мотивы Фиолетовым цветом обозначен аргинин, желтым- глутаминовая кислота. Зеленым выделен мотив, записанный в однобуквенном коде.
Третичная структура
Аминокислоты, отвечающие за функцию мотива Аргинин Глутаминовая кислота
Схема связывания мотива и антигена
Координация антигена
Мотив ArgH52-LysH61
Связывание мотива ArgH52- LysH61
Сравнение электростатического связывания мотивов Мотив ArgH52-GluH61Мотив ArgH52-LysH61
Итоги Мотив ArgH52 - GluH61, входящий в каноническую структуру H2-12-1, встречается в 4% антител, для которых имеются рентгенографические данные; В 66 из 67 антител данный мотив непосредственно участвует во взаимодействии с антигеном; Функция аминокислоты аргинина заключается в образовании ионной пары с отрицательно заряженной группой антигена; Функция глутаминовой кислоты заключается в координации боковой цепи аргинина в наиболее выгодной для связывания точке пространства.
Спасибо за внимание!