Башева Екатерина Научный руководитель: д.б.н., проф. Бородин Павел Михайлович Лаборатория рекомбинационного и сегрегационного анализа ИЦиГ СО РАН 2008.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Научно-исследовательское общество «Физикон» руководитель :Мельникова Т.А Научно-исследовательское общество «Физикон» руководитель :Мельникова Т.А.
Advertisements

Урок повторения по теме: «Сила». Задание 1 Задание 2.
Д.В. Юдкин Цитогенетическая и молекулярная организация В-хромосом хищных семейства Canidae Научный руководитель д.б.н. А.С.Графодатский Лаборатория цитогенетики.
1. Определить последовательность проезда перекрестка
Тренировочное тестирование-2008 Ответы к заданиям КИМ Часть I.
Ф. Т. Алескеров, Л. Г. Егорова НИУ ВШЭ VI Московская международная конференция по исследованию операций (ORM2010) Москва, октября 2010 Так ли уж.
Сравнительный анализ рекомбинационных характеристик геномов млекопитающих. Башева Екатерина Андреевна, Белоногова Надежда Михайловна, Торгашева Анна Александровна.

Типовые расчёты Растворы
Возможно ли оценить эффективность образования в стране с помощью сравнительных международных мониторингов? (на примере международного исследования PISA)
Тема 11 Медицинская помощь и лечение (схема 1). Тема 11 Медицинская помощь и лечение (схема 2)
Анализ воспитательной работы В ГБС(К)ОУ школе учебный год.
Ребусы Свириденковой Лизы Ученицы 6 класса «А». 10.
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ГЕНОВ Авторы: Власова Нина Григорьевна и Ситникова Евгения Сергеевна.
Сопоставительный анализ годовых отметок и отметок, полученных на ЕГЭ по русскому языку г. п/п Отметка,
ИД «Первое сентября». Журнал «Физика» 2/ Роза ветров 9 ИД «Первое сентября». Журнал «Физика» 2/2014.
1 ПРЕЗЕНТАЦИЯ ПАКЕТА ПРОГРАММ «STEP+» Численное исследование автономных систем обыкновенных дифференциальных уравнений и нелинейных уравнений общего вида.
1 Знаток математики Тренажер Таблица умножения 2 класс Школа 21 века ®м®м.
Каратанова Марина Николаевна МОУ СОШ 256 г.Фокино.
Масштаб 1 : 5000 Приложение 1 к решению Совета депутатов города Новосибирска от _____________ ______.
Транксрипт:

Башева Екатерина Научный руководитель: д.б.н., проф. Бородин Павел Михайлович Лаборатория рекомбинационного и сегрегационного анализа ИЦиГ СО РАН 2008

Цель работы: Анализ частоты и распределения точек кроссинговера у собаки и лисицы и сравнение результатов с данными, полученными на других видах млекопитающих.

Задачи: Оценка общего количества кроссоверов на геном у собаки и лисицы. Оценка закономерностей распределения обменов по бивалентам. Исследование вовлеченности В-хромосом в рекомбинационный процесс и их влияния на обмены в А-хромосомах.

(а) Лептотена: возникновение множественных DSB, образование СК (б) Зиготена: возникновение гетеродуплексов между гомологами (в) Пахитена: завершение спаривания хромосом и созревание рек. узелков

DAPI SCP3 ANA-C MLH1 DAPI SCP3 ANA-C MLH1 CК: ± 21.5 μm MLH1: 40.0 ± 1.4 Ген. карта: 2050 cM Интенсивность рек. : 0.76cM/Mb Сперматоцит домашней собаки на стадии пахитены

0,75 0,28 0,47 2 MLH1 1 MLH1

MLH1 1 MLH1

Интерференция Rad51 MLH1 = 6-7 MLH1 = RAD51 = 261 Распределение дистанций между соседними MLH1 N= Оценка интерференции с помощью параметров гамма - распределения N= 1 - интерференции нет N= 4 - интерференция слабая N= 14 - интерференция сильная

CК (А): ± μm MLH1(А): 29.6 ± 2.4 Ген. к арта: 1530 cM Интенсивность рек. : 0.54 сМ/ Mb DAPI SCP3 ANA-C MLH1 DAPI SCP3 ANA-C MLH1 Сперматоцит лисицы на стадии пахитены

MLH1 2 MLH1 1 MLH1

b Синаптонемный комплекс В хромосом лисицы на стадии пахитены полностью спаренные бивалентышпилькообразные униваленты DAPI SCP3 MLH1 CК: 1.7 ± 0.5 μm

N B-хромосом MLH1 на А-хромосомах r = 0.03, P = 0.49 Зависимость числа сайтов MLH1 на А-хромосомах от числа В-хромосом.

Основные рекомбинационные характеристики млекопитающих Интерференция N=6.5 N=3.4

Выводы: 1. С использованием иммунолокализации белка MLH1, маркирующего сайты кроссинговера на синаптонемных комплексах, получены точные оценки общей длины генетических карт аутосом самцов собаки сМ лисицы сМ 2. Анализ распределения сайтов кроссинговера по бивалентам собаки и лисицы позволил выявить общие характеристики паттернов рекомбинации у этих видов и их различия. У обоих видов наблюдалась высокая частота рекомбинации в дистальных районах бивалентов и низкая в проксимальных. У лисиц подавление рекомбинации в районе центромер было более сильным, чем у собак. По-видимому, это обусловлено различиями в морфологии хромосом: двуплечие у лисиц и акроцентрические у собак.

Выводы: 3. На основе анализа распределения дистанций между соседними кроссоверами на бивалентах собаки на стадии пахитены и прямого подсчета сайтов локализации белка RAD51 на стадии лептотены получены совпадающие оценки числа двунитевых разрывов. Этот результат свидетельствует в пользу «счетной» гипотезы кроссоверной интерференции. 4. Обнаружены сигналы MLH1 на добавочных В-хромосомах лисицы. Это является первым прямым доказательством рекомбинации в В - хромосомах млекопитающих.