Лекция 7 Мир РНК
ДНК РНКБелок Метаболиты
Аптамеры
SELEX
Аптамеры Аптамерами называют небольшие молекулы нуклеиновых кислот, которые могут выполнять функции высокоспецифичных рецепторов низкомолекулярных органических соединений. Larry Gold
Riboswitch The adenine ligand (Ade)
Riboswitch
SiRNA miRNA МикроРНК (англ. MicroRNA, miRNA) представляют собой некодирующие РНК длиной нуклеотида, принимающие участие в регуляции экспрессии генов. МикроРНК связываются со специфическими последовательностями мРНК в 3'- нетранслируемой области и вызывают ингибирование трансляции либо удаление поли(А)-хвоста.
SiRNA miRNA Вторичная структура стебелек- петля пре-микроРНК из Brassica oleracea Механизм синтеза
РНК-интерференция RISC - RNA-induced silencing complex
Антисенс-РНК Антисмысловые РНК (англ. Antisense RNA) это одноцепочечные РНК, которые комплементарны мРНК, транскрибируемой в клетке. Антисмысловые РНК вводят в клетки для ингибирования трансляции комплементарных мРНК за счет того, что антисмысловые РНК спариваются с мРНК- мишенью и физически препятствуют формированию трансляционного комплекса. Данный эффект поэтому является стехиометрическим.
Рибопереключатели – структурно функциональные природные и искусственные аптамеры участвующие в регуляции транскрипции и трансляции Локализуются в структуре м-РНК (чаще в 3UTR)
Известные рибоперекюлчатели SAM-рибопереключатель SAH- Кобаломиновый рибопереключатель FMN- glmS- Глутаминовый Лизиновый SAM-SAH-
Cis-regulatory elements Сдвиг рамки Ответ на железо (кооперация с железо сенсорными белками IRP iron response proteins) Cеленоцистеин инсерционные элементы (напрвляют аппарат трансляции для использования UGA стоп кодон в качестве матрицы при включении в полипептид модифицированной аминокислоты) Лидерные пептиды Рибопереключатели
Структура лизинового рибопереключателя
S-метиладенозингомоцистеин рибопереключатель Рибопереключатель для ц-диГМФ 1