Возможности Swiss PDB Viewer Якимов. 3D модель белка Различимы все атомы белка. Синие – положительно заряженные; Красные – отрицательно заряженные; Желтые.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
RuBisCO Рибулозобисфосфаткарбоксилаза EC Выполнил: Чижова Анастасия ФБ 09-01С Красноярск 2014 МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ.
Advertisements

Моделирование в программе Swiss-PDB Viewer NADH:FMN-оксидоредуктаза Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального.
Белки - сложные высокомолекулярные природные соединения, построенные из остатков α-аминокислот. Аминокислоты в белках связаны пептидными связями. Около.
БЕЛКИ Высокомолекулярные органические вещества, состоящие из альфа - аминокислот, соединённых в цепочку пептидной связью.
Киназа лёгких цепей миозина THE HUMAN MYOSIN LIGHT CHAIN KINASE.
Строение, свойства и функции белков Структура аминокислот, пептидная связь. Структурная организация белков. Физико-химические свойства белков. Классификация.
Белки Нерегулярные биополимеры, мономерами которых являются аминокислоты.
Анализ роли мотива ArgH52–GluH61 в связывании антигенов антителами Презентацию подготовил ученик 10 Н класса СУНЦ МГУ Петров Артем под руководством О.В.Колясникова.
Строение и свойства белков. Строение белков. Белки состоят из остатков аминокислот, соединенных пептидными связями, отсюда их второе название- полипептиды.
" БЕЛКИ" ИНТЕГРИРОВАННЫЙ УРОК химия-биология Гимназия искусств при Главе РК, г. Сыктывкар.
Гармоничные цветовые сочетания 6 всегда работающих схем.
Белки Белки - это высокомолекулярные природные полимеры, построенные из остатков α-аминокислот и соединённые пептидной связью. Белки - это высокомолекулярные.
Ф.Энгельс. Жизнь есть способ существования белковых тел, существенным моментом которого является обмен веществ с окружающей их природой, причем с прекращением.
Вопрос 1 Что показывает потенциал поля в данной точке.
Потенциальная энергия заряженного тела в однородном электростатическом поле.
Мазиной Юлии 8А. Радуга атмосферное оптическое и метеорологическое явление, наблюдаемое обычно в поле повышенной влажности. Оно выглядит как разноцветная.
Проводники – вещества, содержащие свободные электроны. 1.Электростатическое поле внутри однородного заряженного проводника отсутствует. 2. При помещении.
Выполнил: Кокшаров Е.В. Учитель биологии школы 112, г. Пермь.
цвета положительные отрицательные нейтральный Положительные Положительные : желтый, красно-желтый (оранжевый) и желто-красный (сурик, киноварь). Создают.
устный счёт на уроке математики 2 класс 4 четверть
Транксрипт:

Возможности Swiss PDB Viewer Якимов

3D модель белка Различимы все атомы белка. Синие – положительно заряженные; Красные – отрицательно заряженные; Желтые – отсутствие информации об аминокислоте в первичных данных и сообщение о том, что программа сама подобрала и вставила наиболее подходящую аминокислоту.

Каркас белка Различимы заряды атомов в каркасе.Различима вторичная структура белка. И там и там видна третичная и четвертичная структуры белка

Поверхность белка Поверхность «обкатывания»Ван-дер-ваальсовая модель

Электростатический потенциал ε=81

Окрашивание Вторичная структура Красные – спирали Желтые – складки Вторичная структура. Градиент от начала до конца (от синего к красному) Доступность Синие – АК внутри молеулы Красные – снаружи Проблемы. (несоответствие модели действительности) В-фактор Красные – подвижные в кристаллической структуре АК Тип Синие – основные Кислые - красные

Карта Рамачандра На карте показаны углы между аминокислотами. За синей чертой – область недопустимых значений. Между синей и желтой – допустимы, но с напряжением. Внутри желтой границы – допустимы. *Глутамин, выделенный зеленым отмечен на карте точкой.

Проблемы «проблемная» аминокислота не всегда лежит в запрещенной области.

Pow Ray

Фантазия… *(добавил 4 стеклянных шарика, красное и зеленое освещение, поменял фон) до после Немного обработки в Pow-Ray…