ГЕНОМЫ ВИРУСОВ РНК-овый геном. Быстро изменяется, так как РНК-полимераза делает много ошибок. Каждая новая молекула РНК имеет 1 ошибку Репликация РНК может сопровождаться делециями, дупликациями и рекомбинациями ( как с вирусными РНК, так и клеточными) Цис- и транссплайсинг и обратный сплайсинг. Такая изменчивость чревата образованием вирулентных штаммов из невирулентных вакцинных
Геномы вирусов Самые простые Очень компактны – содержат только гены, тесно прилегающие друг к другу, иногда перекрывающиеся первый полностью секвенированный геном: бактериофаг φХ н.п. 9 генов
Геномы вирусов Число генов – от 3 – 30 у простых вирусов до 200 у самых сложных. ДНК или РНК 1-цепочечная или 2-цепочечная линейная или кольцевая одна молекула или несколько
Гемагглютинин РНК – 8 молекул, (-) цепи Вирус гриппа Реплицируется в ядре, РНК РНК Высокомутабильный Геном – н. 10 генов в 8 молекулах РНК
Частота мутаций у вирусов Наиболее мутабильны вирусы с РНК- геномами – поскольку синтез РНК у всех организмов менее точен, чем синтез ДНК. У большинства РНК-вирусов (гриппа, атипичной пневомнии) частота мутаций составляет 10 –5 нуклеотидов в день. У вируса ВИЧ (РНК ретровирус) она в три раза выше.
Практические приложения вирусной геномики Консервативные сайты позволяют определить жизненно важные гены выработать лекарства, специфичные к данному вирусу. Высокомутабильные сайты прогнозировать способность вирусов находить нового хозяина.
1-цепочечные РНК-вирусы, цикл размножения которых обязательно включает ДНК – вирус Саркомы рауса у птиц 1930е – 1970е РНК-вирусы рака у птиц и мышей 1962 – Темин, гипотеза «стадии провируса» 1969 – Huebner, Todaro – гипотеза онкогена в составе вируса 1970 – Темин, Балтимор – открыли обратную транскриптазу 1978 – Bishop, Varmus – онкогены вирусов происходят от генов хозяина 1981 Gallo – ретровирус человека (HTLV-Human T Cell Leukemia Virus) 1983 – Barre-Sinoussi – выделен вирус ВИЧ Ретровирусы
трансмембран- ные белки липидной оболочки матрикс капсид нуклеокапсид Ревертаза Интеграза Протеаза Гены и белки вируса ВИЧ Ферменты Структурные белки 3 гена – gag, pol и env
Жизненный цикл ретровируса Все ретровирусы имеют в жизненном цикле стадию провируса – встраивания в хозяйский геном
Интеграция ретровируса в хромосому хозяина