Метаболические пути. БД KEGG. Метаболический путь – сеть ферментативных реакций, таких, что продукт одной реакции является субстратом другой. Принято.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Функции. Ферменты. Метаболические пути. А.Б.Рахманинова, 2010.
Advertisements

Стандартная запись Swiss-Prot. Стандартные поля: entry, name, origin Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие идентификаторы соответствующей.
Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров.
Комплексный подход для формального описания, графического представления и моделирования широкого круга биологических и других сложных систем Biosoft.Ru.
BioUML универсальный язык для визуального моделирования биологических систем Biosoft.Ru Лаборатория Биоинформатики КТИ.
Ген-ориентированные базы данных и геномные браузеры Что такое ген-ориентированные базы данных? Самые простые примеры таких БД Примеры геном-ориентированных.
Моделирование биологических систем с использованием BioUML Biosoft Лабоработория Биоинформатики КТИ ВТ СО РАН
Функции II. Классификация. Зачем? А.Б.Рахманинова (6 марта 2006 г.)
Человеческие расы. РАСА - от итальянского Razza - род, порода, племя. Современное человечество представлено единым биологическим видом Homo sapiens. Вид.
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции.
Функции Повторение Д.А. Равчеев (31 марта 2009 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр.
Выполнила: студентка 4 курса Захарова Ольга БФ0801С
Сеть здания.
~ 2,5- 2 млн. лет назад – выделение рода Homo ~ 400 – 250 тыс. лет назад – появление первых представителей вида Homo Sapiens ~ 40 тыс. лет назад – появление.
Я Ферме́нты или энзи́мы (от лат. fermentum, греч. ζύμη, νζυμον закваска) обычно белковые молекулы или молекулы РНК(рибозимы) или их комплексы, ускоряющие.
Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс.
4. Ингибирование ферментативных реакций. Методы описания и определения констант ингибирования. Применение элементов теории графов для вывода кинетических.
Создание Базы данных. Создание Базы данных. Таблица с данными.
Эволюция геномов М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, ШБ 2 год, ПФУ Весна 2013.
Экспрессия TLR и цитокиновый профиль при различной антигенной нагрузке Петров Вячеслав Алексеевич студент 6 курса лечебного факультета ГБОУ ВПО СибГМУ.
Транксрипт:

Метаболические пути. БД KEGG

Метаболический путь – сеть ферментативных реакций, таких, что продукт одной реакции является субстратом другой. Принято изображать в виде графа, вершинами которого являются идентификаторы реактантов. Метаболический путь

KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes

KEGG: 16 основных БД

KEGG: система идентификаторов KEGG PATHWAY KEGG GENOME KEGG GENES KEGG ENZYME KEGG COMPOUND KEGG REACTION KEGG ORTHOLOGY KEGG GLYCAN KEGG RPAIR KEGG BRITE KEGG DRUG KEGG MODULE KEGG DISEASE map number organism code (T number) locus_tag/NCBI GeneID EC number C number R number K number G number A number br number D number M number H number С лизин K04527 – инсулиновый рецептор hsa5210 – путь возникновения рака простаты

KEGG PATHWAY 91,564 пути на основе 345 «reference pathways» KEGG: биологические процессы Reference pathway Homo sapiens