Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Метаболические пути. БД KEGG. Метаболический путь – сеть ферментативных реакций, таких, что продукт одной реакции является субстратом другой. Принято.
Advertisements

Развитие цветка резухи Таля двойная кластеризац ия – на генах и на условиях.
Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс.
Стандартная запись Swiss-Prot. Стандартные поля: entry, name, origin Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие идентификаторы соответствующей.
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции.
TASK 1 Write words for the things in the picture in the correct part of the table. [ ]
PetroGen Bioinformatics Ltd. Versuche über Pflanzen-Hybriden (1865) von Gregor Mendel. Gregor Johann Mendel, PetroGen Bioinformatics Ltd.
Комплексный подход для формального описания, графического представления и моделирования широкого круга биологических и других сложных систем Biosoft.Ru.
Ген-ориентированные базы данных и геномные браузеры Что такое ген-ориентированные базы данных? Самые простые примеры таких БД Примеры геном-ориентированных.
СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
Права ребёнка. СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
Спасибо за внимание!
Спасибо за урок
Спасибо за внимание!!!
Спасибо за внимание!
СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!!!
СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
Спасибо за внимание!
Спасибо за внимание!!!
Транксрипт:

Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров

Рассеянный склероз

Методика Данные: профиль экспрессии генов при рассеянном склерозе Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) – база знаний по систематическому анализу функций генов – pathway UCSC – transcription factors NCBI – chromosome annotation information

Инструменты differentially coexpressed genes and links (DCGL) package in R Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) Regulatory impact factor:

Результаты (1) Найдены зависимости между 42-мя транскрипционными факторами и соответствующим им 243-м генам Найдены транскрипционные факторы, оказывающие наибольшее влияние на экспрессию генов при рассеянном склерозе

Результаты (2) Отношение между 5-ю транскрипционными факторами и соответствующими им генами Определены основные метаболитические пути, соответствующие использованному профилю экспрессии генов

Спасибо за внимание