Расчет параметров связывания противоопухолевого антибиотика ActII с ДНК методом ДСК РФФ, кафедра медицинской и биологической физики Ткаченко Е.С. Работа.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
ХИМИЧЕСКОЕ РАВНОВЕСИЕ. Признаки установления химического равновесия : 1. Неизменность во времени – если система находится в состоянии равновесия, то ее.
Advertisements

Календарный план работы потока ЭР-06 Учебная неделя Лабораторные работы 3(1)5(1)7(2)К.1 С.р. 2(1) 6(2,3)13(2) 14(1)
Обратимость химических реакций Химическое равновесие.
Неравновесная термодинамика и выбросоопасность газосодержащих угольных пластов А. Д. Алексеев, Э. П. Фельдман Институт физики горных процессов НАН Украины.
Доклад Изучение структурной стабильности и способов её повышения в 12% хромистых сталях с целью безопасности эксплуатации конструкционных элементов в атомной.
ХИМИЧЕСКАЯ ТЕРМОДИНАМИКА ФИЗИЧЕСКАЯ ХИМИЯ. ЛЕКЦИЯ 6.
Термодинамика суперионных проводников А.Н.Титов Институт физики металлов УрО РАН Ул. C. Ковалевской, 18, Екатеринбург, , Уральский госуниверситет.
Лекция 3 Теплоемкость. Второе начало термодинамики.
1 Термохимия Типы энтальпии Теплоемкость Закон Кирхгофа Закон Гесса.
2. Комплексы биополимеров с лигандами. Специфические взаимодействия. Методы определения констант равновесия Физико-химические основы биокатализа в иллюстрациях.
Лекция 7 Молекулярная физика и термодинамика. Тепловое равновесие. Температура. Молекулярная физика и термодинамика изучают свойства и поведение макроскопических.
Введение в молекулярную биофизику Лекция 5. План лекции: Конфигурационная статистика полимерных цепей. Свободно-сочленненная цепь. Гибкость полимера.Конфигурационная.
В единице V (для гомогенной) На единице поверхности соприкосновения веществ S (для гетерогенной) n - изменение количества вещества (моль); t– интервал.
Физическая химия. Термодинамика.. 2 Теплоемкость. Виды теплоемкости. Теплоемкость – количество теплоты, необходимое для нагревания единичного количества.
Термохимия Энергия (Е) - способность системы производить работу Работа (А) газа при его расширении: Е = р V (Дж = н м) Реакции с поглощением энергии -
Две задачи физики нейтрино студента 607 группы А. В. Лохова. Научный руководитель доктор физ.-мат. наук, профессор А. И. Студеникин. Резенцент доктор физ.-мат.
ХИМИЧЕСКАЯ ТЕРМОДИНАМИКА ФИЗИЧЕСКАЯ ХИМИЯ. ЛЕКЦИЯ 6.
Учитель физики: Мурнаева Екатерина Александровна Температура и тепловое равновесие. Определение температуры.
Исследование влияния примесей ниобия и тантала на полиморфизм вольфрамата висмута Маслов Антон Научный руководитель: с.н.с., к.ф.м.н., Харитонова Е.П.
Химическое равновесие. Химическое равновесие – состояние системы, при котором скорости прямой и обратной реакции равны между собой. Принцип Ле Шателье.
Транксрипт:

Расчет параметров связывания противоопухолевого антибиотика ActII с ДНК методом ДСК РФФ, кафедра медицинской и биологической физики Ткаченко Е.С. Работа выполнена в отделе криобиофизики Института проблем криобиологии и криомедицины НАН Украины, Харьков, Украина Руководитель: д.б.н., профессор Зинченко А.В.

Типы взаимодействия биологически активных веществ с ДНК Связывание в бороздке ИнтеркаляцияНеспецифический внешний тип связывания

Актиномицин D Act II Цель работы исследование влияния ActII на термодинамические параметры плавления ДНК определение параметров связывания лиганда с ДНК N OO NH 2 OONH NN H3CH3C CH 3 NH O N O NH 2 OO L-Thr L-N-MeVal Sar L-Pro D-Val O L-Thr L-N-MeVal Sar L-Pro D-Val O

Методы Измерения теплопоглощения свободной ДНК и ДНК в комплексах с ActII проводились на дифференциальном адиабатическом сканирующем микрокалориметре ДАСМ-4 Схема сканирующего микрокалориметра

Параметры плавления, определяемые из данных ДСК Параметры связывания, определяемые из данных ДСК δH = H компл - H ДНК δ H = r·H связывания где δ Н - разница в энтальпии плавления одного моля нуклеотидов свободной ДНК и ДНК в составе комплекса с лигандом; r – количество молей лиганда, связанного с одним молем нуклеотидов. характеристические температуры перехода : - Т 1/2 -температура при которой 50% ДНК находится в расплетенном состоянии -T m max – температура в максимуме пика перехода -Т G – температура при которой стандартный термодинамичес­кий потенциал Гиббса (ΔG) равен 0. -T-температурный интервал плавления

Кривые теплопоглощения свободной ДНК и комплексов ДНК – Act II при различных значениях P/D.

Зависимости ΔH, Δ S и Δ G от относительной концентрации ActII (D/Р)

Интегральные кривые плавления комплексов ДНК- ActII

Зависимость температуры и температурного интервала плавления от соотношения концентрации ДНК-ActII

Энтальпия и свободная энергия связывания, приходящаяся на моль ActII

Выводы 1. Из дифференциальных кривых плавления определены термодинамические параметры плавления комплексов ДНК-ActII при различных концентрациях ActII. 2. Показано, что АсtII может образовывать с ДНК два термодинамически различных типа комплексов. Оба типа комплексов приводят к увеличению температуры, H, S, G плавления ДНК. 3. Зависимость температуры плавления от P/D носит нелинейный характер. Уменьшение интервала плавления при P/D