Сериновые протеазы Ковалентный катализ. Сериновые протеазы В активном центре остаток Ser Система переноса заряда Ser …His …Asp Ковалентный механизм катализа,

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Белки ферментативный катализ транспорт структура (цитоскелет и т.п.) передача сигнала.
Advertisements

ОБМЕН ПРОСТЫХ БЕЛКОВ. Переваривание пищевых белков начинается в желудке и завершаеся в тонком кишечнике под действием протеолитических ферментов (пептидгидролаз,
ФерментыФЕРМЕНТЫ (энзимы) - это высокоспецифичные белки, выполняющие функции биологических катализаторов. Катализатор - это вещество, которое ускоряет.
Физическая химия биополимеров Лаврик О.И.. 1. Структурная организация активного центра ферментов. Строение активных центров ферментов на примерах карбоксипептидазы,
ферменты Определение, строение, свойства, использование ферментов человеком.
Белки Белки – высокомолекулярные природные соединения (биополимеры), состоящие из остатков аминокислот, которые соединены пептидной связью. Белки Протеины.
3. Стационарная кинетика ферментативных реакций. Уравнение Михаэлиса-Ментен. Физический смысл параметров уравнения Михаэлиса (K M, V max ). Значение параметра.
Белки Жизнь – это способ существования белковых тел. Ф.Энгельс.
РЕГУЛЯЦИЯ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ.
Биохимия как наука: биомолекулы, метаболические пути. Строение и свойства ферментов. Механизм действия ферментов. Изоферменты, классификация ферментов.
Белки (полипептиды) биополимеры, построенные из остатков -аминокислот, соединенных пептидными связями. Пептидной связью называют амидную связь –CO–NH–,
Белки Жизнь – это способ существования белковых тел. Ф.Энгельс.
1 Органические биополимеры –белки. 1 2 Введение Из органических веществ клетки по количеству и значению на первом месте стоят белки. Для понимания сущности.
Фармакодинамика Основной задачей является выяснение механизма действия БАВ на разных уровнях организации организма: органов, тканей, клеток и белковых.
Лизоцим 1922 Открыт сэром Александром Флемингом, который изучал анти- бактериальное действия слизи носовой полости.
Химический состав, строение и структура белков. Коробова Н. и Беляева С. ученицы 10 класса.
ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ, МЕХАНИЗМЫ И ЗАКОНОМЕРНОСТИ ПРОТЕКАНИЯ ОРГАНИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ Гетерогенные Компоненты нах. в разных фазах (граница между фазами – поверхность.
Перфильева Г. В ГБОУ ВПО КрасГМУ имени профессора В.Ф. Войно – Ясенецкого Минздрав РФ Фармацевтический колледж.
Что такое жизнь с точки зрения химика Вода. Биологические мембраны Структура и функция белка Обмен веществом. Преобразование.
Белки Презентация подготовлена доцентом ИМОЯК ТПУ, д.м.н. Проваловой Н.В.
Транксрипт:

Сериновые протеазы Ковалентный катализ

Сериновые протеазы В активном центре остаток Ser Система переноса заряда Ser …His …Asp Ковалентный механизм катализа, нуклеофил O боковой цепи Ser Необратимо ингибируются: - диизопропилфторфосфатом (DFP) - фенилметансульфонилфторидом (PMSF) - хлорметилкетонами

Каталитическая триада His-Asp-SerХимотрипсин Asp-His-SerСубтилизин Ser-Asp-HisКарбоксипептидаза Y Ser-His-AspClp-протеаза «нестандартные» сериновые протеазы Ser-Lys Ser-His-Glu Ser-His

Трехмерная структура «Внешний вид» α-химотрипсина

Трехмерная структура Схема трехмерной структуры α-химотрипсина Выделены остатки каталитической триады Ser195 His57 Asp102 и фрагмент пептидного субстрата

Каталитическая триада оксианионная впадина

Субстрат-связывающий участок: карман S1 Трипсин: Asp189, Gly216,Gly226 Химотрипсин: Ser189 Эластаза: Val216, Thr226 Гранзим B Arg226

Активация профермента Отрезается 15 остатков с N-конца «Домен активации»: меняет форму Образуется солевой мостик Ile16…Asp194 Формируется субстрат- связывающий участок

Активация профермента Отрезается 15 остатков с N-конца «Домен активации»: меняет форму Образуется солевой мостик Ile16…Asp194 Формируется субстрат-связывающий участок

Механизм ковалентного катализа первый тетраэдрический аддукт второй тетраэдрический аддукт ацил-фермент

Каталитический акт: накануне

Тетраэдрический аддукт

ацил-фермент Нуклеофил молекула воды

Второй тетраэдрический аддукт Расщепляется с образованием продуктов реакции

Ацил-фермент можно наблюдать экспериментально Светлый контур – pH 2 Розовый контур – pH 10