Структура РНК
Основные свойства 1. Одноцепочечная молекула 2. В клетке найдено множество типов РНК и каждый из них имеет специфичную функцию Основные типы: рРНК, мРНК, тРНК Другие – рибозимы, регуляторные, праймеры, геномы вирусов,....
РНК и ДНК. РНК и ДНК.
Почему важна структура РНК? 1. Структура РНК определяет её функцию: А) Регуляторная Б) Структурная В) Каталитическая (рибозимы) 2. Некоторые вирусы имеют РНК геном (HIV,грипп)
Вторичная структура РНК.
Вторичная структура Петля (loop) Внутренняя Петля (Internal loop) Спираль, или стебель (stem) Мультипетля(junction) Выпетливание(Bulge) Псевдоузел(Pseudoknot)
Возможность предсказания вторичной структуры GGCGACUGGUGAGUACGCC
Расчёт энергии структуры по алгоритму Зукера UU Петля +5.9 Ккал/моль UU Петля +5.9 Ккал/моль A A A A G C Стэкинг+Пара –2*2.9 Ккал/моль G C Стэкинг+Пара –2*2.9 Ккал/моль G C G C A Выпетливание Ккал/моль A Выпетливание Ккал/моль G C Стекинг+Пара –1.8 Ккал/моль G C Стекинг+Пара –1.8 Ккал/моль U A -0.9 Ккал/моль U A -0.9 Ккал/моль A U -1.8 Ккал/моль A U -1.8 Ккал/моль C G -2.1Ккал/моль C G -2.1Ккал/моль A U 3 A U 3 A Неструктурированный 5` конец 0 Ккал/моль A Неструктурированный 5` конец 0 Ккал/мольA 5 G = -3.2 Ккал/моль G = -3.2 Ккал/моль
РНК, которые трудно предсказать алгоритмом Зукера РНК связанная с белками РНК связанная с белками Длинные РНК Длинные РНК Псевдоузлы Псевдоузлы
Вопросы?