Молекулярная эпидемиология гепатита А на территории России и сопредельных государств Неверов А.Д., Карандашова И.В., Браславская С.И., Чуланов В.П. ФГУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Москва, Россия Москва, Россия Международная школа по биоинформатике, геномике и протеомике г.Алма-Ата, апреля 2006 г. Международная школа по биоинформатике, геномике и протеомике г.Алма-Ата, апреля 2006 г.

Вирус гепатита А Семейство – Picornaviridae Род - Hepavirus Геном – ssRNA, ~7500 bp Механизм передачи – фекально-оральный Хозяева – человек и приматы Клиника – острый гепатит Высоковариабельный P1 структурные P2 P3 неструктурные Высококонсервативный VP4 VP3 VP2 VP1 2A 2B 2C 3A 3B 3C 3D 5-NCR3-NCR

Распространенность HAV-инфекции Высокая Средняя Низкая Очень низкая

Генотипы вируса гепатита А V IV II IIIB IIIA IB IA NJ, K80

Распространенность генотипов HAV IA IB IIIA IIIB IA IB II IIIA

Метод генотипирования HAV на основе праймерспецифичной ПЦР VP4 VP3 VP2 VP1 2A 2B 2C 3A 3B 3C 3D 5-NCR3-NCR R1B F1 R1A Субтипы 1А, 1В R3AR3AF3F3 R3BR3B Субтипы 3А, 3В 3A3A 3B3B 1A 1B

Генотипы HAV в России Таджикистан Киргизия N=22 Москва Волгоград Йошкар-Ола Тюмень Омск N=134 N=12 N=10 N=5 N=25 Владивосток N=3 Якутск N=31 Украина N=15 94% 6% N=105 N=231

Секвенирование фрагментов генома HAV VP4 VP3 VP2 VP1 2A 2B 2C 3A 3B 3C 3D 5-NCR3-NCR

Геном HAV обладает высокой генетической стабильностью Геном HAV обладает высокой генетической стабильностью Изоляты, циркулирующие в начале и в конце вспышек гепатита А, идентичны Изоляты, циркулирующие в начале и в конце вспышек гепатита А, идентичны

Расследование вспышек ü Вспышка гепатита в Тверской области, май – июнь 2005 ü 662 зарегистрированных случая

70 км 30 км Оленино Ржев Зубцов

Ржевский район Зубцовский район Оленинский район 20 мая – 15 июня 2005 г.

Исследовано12 образцов Штамм U2-U3 Исследовано 34 образца Штамм U2-U3 Исследовано15 образцов Штамм U2-U3 Вспышка гепатита в Тверской области

Расследование вспышек Вспышка гепатита в г. Нижний Новгород, сентябрь – октябрь 2005 Вспышка гепатита в г. Нижний Новгород, сентябрь – октябрь зарегистрированных случаев 2912 зарегистрированных случаев

р. Ока р. Волга Динамика подъема заболеваемости Распределение заболевших на

Схема городского водоснабжения Новосормовская ВОС р. Волга р. Ока Правдинск

Распределение штаммов HAV р. Волга р. Ока Новосормовская ВОС

Наблюдение за циркулирующими штаммами Исследование спорадической заболеваемости

География распространения HAV генотип I Россия, Украина, Киргизия,ТаджикистанНорвегия Испания Италия Япония Китай Бразилия Германия Тунис Minimum Evolution, F81 (π A +π C +π G +π T =1 F81 (π A +π C +π G +π T =1) Испания, Италия, Тунис IB IA VP1/2A 300 нк. СНГ

География распространения HAV генотип III Россия, Украина, Киргизия,Таджикистан Норвегия Испания Великобритания Германия Minimum Evolution, F81 (π A +π C +π G +π T =1) VP1/2A 300 нк.

IA 54% спорадических случаев на территории Европейской части РФ Полтава, Украина Завозные штаммы из Средиземноморского региона Якутия субтип IA Россия Якутия, РФ Украина Киргизия Таджикистан Minimum Evolution, F81 (π A +π C +π G +π T =1) VP1/2A 400 нк.

Вспышка среди лиц, употребляющих наркотики, Москва 1999 г. Штаммы выделенные во время вспышек Эволюция HAV

Выводы ü Выявление циркулирующих штаммов позволяет уточнять эпидемиологию вспышек, выявлять завозные штаммы ü Популяция вируса HAV в эндемичных регионах состоит из филогенетически близких штаммов (квазивидов) с динамически изменяющимся соотношением