Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, 384-394, 2006.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, , 2006.
Advertisements

Введение в эволюционную и медицинскую геномику. (или гугл «Эволюционная и медицинская геномика»)
Восстановление филогений. наименьшее расстояние (distance-based methods), кластеризация быстро хорошо, если сходство ~ родство (молек. часы) наибольшая.
Введение в эволюционную и медицинскую геномику. Часть 1: Введение в эволюционную геномику Егор Базыкин 9 октября 2007 г.
Популяционная генетика - 6. Факторы эволюции мутации отбор половое размножение генетико-автоматические процессы (генетический дрейф) миграция.
У них нет перьев У них нет перьев Число ног – 2. Число ног – 2. Тело покрыто перьями. Тело покрыто перьями. Есть крылья и клюв. Есть крылья и клюв. Основные.
Эволюция жаберных дуг. Эволюция артериальных жаберных дуг рыб.
=> мутационно-селективное равновесие => мутационный груз, новые вредные мутации => как можно уменьшить мутационный груз: => функция приспособленности и.
Метод максимального правдоподобия Прикладная генетика для зоологов, лекция 7 Мюге Н. С.
Популяционная генетика - 5. Факторы эволюции мутации отбор половое размножение генетико-автоматические процессы (генетический дрейф) миграция.
Филогенетика: реконструкция эволюционного сценария.
Спектр задач, решаемых с применением МФА Выявление таксонов высокого уровня (напр., работа Woese и др.) Построение системы крупных групп организмов (в.
Многообразие рыб Урок окружающего мира с использованием методов и приемов по развитию критического мышления учащихся по УМК «Гармония», 1 класс Учитель:
Презентация Окружающий мир 2 класс по учебнику Н. Я. Дмитриевой, А. Н. Казакова ( система Л.В.Занкова) Разработала презентацию учитель начальных классов.
Конференции НП АДИТ в цифрах. О чем говорит статистика?
В.П. Гринин, И.С. Потравнов, Ф.А. Мусаев ГАО РАН Пулково, САО РАН
Строение и функции вомероназального органа.. ВНО мыши (рисунок von Mihalkovics 1899)
Филогенетические деревья. 1) Алфавит без пробелов5 2) Кол-во выравниваний10 3) Глобальное выравнивание10 4) Локальное выравнивание7 5) Афинные гэпы8 6)
Промчались зимы с веснами, Уже вы стали взрослыми, Но вспомним ваши школьные деньки…
ИССЛЕДОВАНИЕ ТРЕХМЕРНЫХ ГЕОМЕТРИЧЕСКИХ И КИНЕМАТИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК КВМ ТИПА ГАЛО В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ВРЕМЕНИ Егоров Я.И., Файнштейн В.Г. ИКИ-2013.
Транксрипт:

Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, , 2006.

пароль для архива со статьями

Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! гомология = невынужденное сходство иерархичность распределения признаков

Иерархичность

эволюция должна быть преимущественно дивергентной бинарные признаки (для простоты) дивергентная эволюция = отсутствие конфликтов Т. о попарной совместимости: дивергентная эволюция ведет только к иерархическому распределению (без конфликтов) Если признаков и видов много, а эволюции нет, то конфликты - норма Иерархичность

хорда => инвертир. глаза => челюсти => 4 ноги и легкие => амнион => шерсть и молоко бедные иерархии: птицы – клювы, нет зубов, перья, нет молока, эритроциты с ядрами, правая дуга аорты; млекопит. – наоборот. морские млекопитающие – только хищники и копытные Примеры иерархического распределения

Nikaido et al. PNAS 1999

Galili and Swanson PNAS 1991

наименьшее расстояние (distance-based methods), кластеризация быстро проблемы наибольшая экономия (parsimony-based methods) если нет гомоплазий – это ПРАВИЛЬНОЕ дерево если есть гомоплазии - медленно maximum likelihood (ML) – обобщение экономии Подходы к построению филогений

Nikaido et al. PNAS 1999

если часы – то легко поляризация аутгруппы (древо жизни?) Как укоренить дерево?

Nikaido et al. PNAS 1999

Aguinaldo et al. Nature 1997

Aguinaldo et al. Nature 1997 Wolf et al. 2004

Irimia et al. 2007

Aguinaldo et al. Nature 1997 Wolf et al Irimia et al Rogozin et al. 2007

Aguinaldo et al. Nature 1997 Wolf et al Irimia et al Rogozin et al. 2007

W.F.Doolittle 2000 Sci Am

2001 Nature

Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions

Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176

Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176 Kimura 2-parameter model

К след. лекции: