Поисковые системы SRS, MRS, Expasy, Entrez О.Н.Занегина.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
SRS – Sequence Retrieval System. Разработчик SRS – фирма LION.
Advertisements

SCOP - Structural Classification Of Proteins Организована в соответствии со структурными семействами белков. Иерархическая система.
Запросы в базе данных. Понятия запроса При работе с таблицами можно в любой момент выбрать из базы данных необходимую информацию с помощью запросов. Запрос.
Поиск данных. Постановка, организация, последовательность поиска МОУ СОШ 2 городского округа город Буй Костромской области.
БАЗЫ ДАННЫХ. ACCESS 2007 © К.Ю. Поляков, Тема. Запросы.
Молекулярный филогенез. ancestor descendant 1 descendant 2 Предположение: жизнь - монофилетична Любые два организма имеют общего предка в прошлом.
Запросы к базе данных. ЗАПРОС – это команда на выполнение определенного вида манипулирования данными.
Цель : научиться, эффективно, использовать Интернет для поиска информации.
ИНСТРУКЦИЯ ПО РАБОТЕ С ЭЛЕКТРОННОЙ БИБЛИОТЕКОЙ. Электронная библиотека НБ РГГУ предназначена для работы с полными текстами трудов преподавателей нашего.
ПРАКТИЧЕСКИЕ СОВЕТЫ ПО РАЦИОНАЛЬНОМУ ПОИСКУ ИНФОРМАЦИИ В СЕТИ INTERNET.
Группа ключевых слов, сформированная по определенным правилам - с помощью языка запросов, называется запросом к поисковому серверу. Языки запросов к разным.
СУБД СЛОЖНЫЕ УСЛОВИЯ ПОИСКА. ВОПРОСЫ НА ПОВТОРЕНИЕ Что такое поле в базе данных? Что такое поле в базе данных? Что называется структурой БД? Что называется.
Элементы БД Таблицы Таблицы Формы Формы Запросы Запросы.
Пополнение информационных ресурсов Интернета происходит высокими темпами, и найти необходимую информацию становиться всё труднее.
Работу выполнил: Булыкин А.А. Содержание Поиск информации Основные способы поиска информации Поисковые серверы
LOGO Создание сложных запросов. LOGO Условия запроса Операции отношений 1 Логические операции 2 Символ ? и * 3 4.
СУБД 5. SQL для выборки данных. 2 SELECT Обработка элементов оператора SELECT выполняется в следующей последовательности: FROM – определяются имена используемых.
БАЗЫ ДАННЫХ. ACCESS 2003 © К.Ю. Поляков, 2007 Запросы.
Структура курсов информатики и биоинформатики. Банки данных Архивные (примеры: PDB, GenBank) за содержание каждой записи отвечает её автор-экспериментатор.
Базы данных Урок информатики и ИКТ, 11 класс Автор: Буравцова Ксения Валерьевна, учитель информатики и ИКТ МАОУ лицея 82 г. Челябинска.
Транксрипт:

Поисковые системы SRS, MRS, Expasy, Entrez О.Н.Занегина

Стартовая страница другие сервера SRS быстрый поиск Основная страница поиска SRS Авторы: T.Etzol с соавт.srs.ebi.ac.uk EMBL, потом LionBioscience,

Начало поиска : Library Page Список банков данных, в которых можно искать Всплывающая подсказка про каждую базу данных PDB в этом свёрнутом разделе Форма для поиска SRS

Страница поиска : Query Form где ищемчто ищем соединяем логическими операторами ставить ли * в конце запроса Какие столбцы будут в конечной таблице Список значений полей SRS

Логические операторы Операторзначениепримеррезультат &ANDи phosphorylase & methyltransferase белки, обладающие обеими функциями одновременно |ORилиrat | mouse мышь и крыса !BUTNOTно неnitrogenase ! reductase нитрогеназы, не являющиеся редуктазами (mammalia|aves)!chicken - звери и птицы, но не курица * - замена любого числа символов: tr*psin trypsin В конце каждого запроса по умолчанию стоит * (Use wildcards включено) mus* mus, mustard, musa… SRS

Страница поиска : Query Form Ищем: трипсин у мыши SRS

Страница результатов : Query Results запрос Параметры отображения результатов Обработка результатов Записи в html Записи в txt SRS

Поля (fields) и их заполнение

Описание полей (fields) Соответствие полям из Swissprot Список индексированных значений SRS

Список индексов (browse index) По запросу mus* в поле Organism выдается список индексированных организмов, начинающихся на mus и количество записей, где они встречаются SRS

MRS Стартовая страница Авторы Hekkelman M.L., Vriend G.

Поиск Case insensitive – регистр не важен * проставляется только вручную Логические операторы AND (&), OR (|) и NOT (!) надо вписывать вручную Неизвестная буква обозначается «?» «-» не буква Поиск по конкретному полю прописывается в строке поиска: «ac:P1234* os:bovine » MRS

Результаты поиска trypsintrypsin ! inhibitor ?

MRS Информация о полях

ExPASy

Entrez

История SRS