Белорусский государственный университет Методы определения структуры хемокинов Методы определения структуры хемокинов Выполнила: магистрантка кафедры микробиологии биологического факультета Гамаюнова Ирина Владимировна Руководители: ст. преподаватель Шешко Сергей Михайлович
СРЕДСТВА ИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ ПРИМЕНЯЮТСЯ В БИОЛОГИИ ПРИ РЕШЕНИИ СЛЕДУЮЩИХ ЗАДАЧ: выявление консервативных участков молекул НК выявление консервативных участков молекул НК сопоставление у разных видов организмов нуклеотидных последовательностей отдельных участков ДНК сопоставление у разных видов организмов нуклеотидных последовательностей отдельных участков ДНК связь геномных и протеомных проектов, связь геномных и протеомных проектов, предсказание функции белка на основании знания его первичной структуры и предсказанной трехмерной структуры предсказание функции белка на основании знания его первичной структуры и предсказанной трехмерной структуры
Типы баз данных в биологии: АРХИВНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ АРХИВНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ КУРИРУЕМЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ КУРИРУЕМЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ ПРОИЗВОДНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ ПРОИЗВОДНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ ИНТЕГРИРОВАННЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ ИНТЕГРИРОВАННЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ
Функции хемокинов – межклеточная сигнализация
Хемокины. Структура IL-8 Хемокины. Структура IL-8
Cтруктура SDF-1
Структура BKT-P3
Нативная структура CXCR2
Совмещение образа, полученного с помощью программы TESSERA, и результатов ЯМР официальный сайт разработчиков программы TESSERA
Этапы построения 3D-модели белка
Достоверность 3D-модели определяют в несколько этапов :
Взаимодействие хемокин – рецептор
Этапы получения производственного продукта:
Преимущества моделирования третичной структуры белков: Применимо для мембранных белков Применимо для белков с неизвестным типом укладки Необходимо знать только последовательность аминокислот в белке
Спасибо за внимание! вернуться к началу презентации