Primate molecular divergence dates. Steiper ME and Young NM Molecular Phylogenetics and Evolution 41, , 2006.
пароль для архива со статьями
Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! гомология = невынужденное сходство иерархичность распределения признаков
бинарные признаки (для простоты) дивергентная эволюция vs. гомоплазия Т.: все сочетания бинарных признаков нельзя получить только дивергентной эволюцией Т. о попарной совместимости: дивергентная эволюция ведет только к иерархическому распределению (без конфликтов) Если признаков и видов много, а эволюции нет, то конфликты - норма Иерархичность
хорда => инвертир. глаза => челюсти => 4 ноги и легкие => амнион => шерсть и молоко бедные иерархии: птицы – клювы, нет зубов, перья, нет молока, эритроциты с ядрами, правая дуга аорты; млекопит. – наоборот. морские млекопитающие – только хищники и копытные Примеры иерархического распределения
Исаев Определитель жесткокрылых Среднего Поволжья 2002
Nikaido et al. PNAS 1999
Galili and Swanson PNAS 1991
кластеризация корень проблемы – напр. притяжение длинных ветвей наибольшая экономия если нет гомоплазий – ПРАВИЛЬНОЕ дерево Подходы к построению филогений
Nikaido et al. PNAS 1999
кластеризация корень проблемы – напр. притяжение длинных ветвей наибольшая экономия если нет гомоплазий – ПРАВИЛЬНОЕ дерево конфликты обычно есть (млек.: 100 млн лет – насыщение) как укоренять? поляризация аутгруппы (древо жизни?) Подходы к построению филогений
W.F.Doolittle 2000 Sci Am
2001 Nature
Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions
Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions
Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions
Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176
Jukes-Cantor model Models of nucleotide substitutions Haubold and Wiehe 2006 Introduction to Computational Biology: an Evolutionary Approach p.176 Kimura 2-parameter model
К след. лекции: