Введение в эволюционную и медицинскую геномику

(или гугл «Эволюционная и медицинская геномика») пароль для архива со статьями

Часть 1: Введение в эволюционную геномику Егор Базыкин 7 октября 2008 г.

Макроэволюция и филогенетика

Эволюция: движение в пространстве состояний

В каком пространстве происходит эволюция? 10 9 bp

Widada and Bonami 2004

Как перемещаться в пространстве? свойства мутаций шаги небольшие. (Лысенко vs. СТЭ)

Два утверждения про эволюцию: 1.Слабое: далекие предки сильно отличались от современных форм. (СТЭ vs. креационизм)

Два утверждения про эволюцию: 1.Слабое: далекие предки сильно отличались от современных форм. 2.Сильное: все современные формы жизни имели давным-давно общего предка все формы жизни соединены непрерывными цепочками промежуточных форм.

Прямые доказательства эволюции ископаемые эволюция в реальном времени искусственный отбор эволюция патогенов экспериментальная эволюция (в основном – микроэволюция)

Прямые доказательства эволюции ископаемые эволюция в реальном времени искусственный отбор эволюция патогенов экспериментальная эволюция (в основном – микроэволюция)

Косвенные доказательства эволюции

приспособленность признаков к условиям среды? pt.northrup.org/photos/crap/Animals/nl-130.htm

Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! Astyanax fasciatus mexicanus

Pleuronectes sp.

en.wikipedia.org

Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! гомология = невынужденное сходство

Nikaido et al. PNAS 1999

compbio.mit.edu/yeast.html

Monteiro, Ferrier Int J Biol Sci 2006

Knight et al Trends in Biol Chem

Knight et al Nature reviews - Genetics

Knight et al Trends in Biol Chem

Доказательства эволюции приспособленность признаков к условиям среды? НЕ-приспособленность (субоптимальность)! гомология = невынужденное сходство иерархичность распределения признаков

бинарные признаки (для простоты) дивергентная эволюция vs. гомоплазия Т.: все сочетания бинарных признаков нельзя получить только дивергентной эволюцией Т. о попарной совместимости: дивергентная эволюция ведет только к иерархическому распределению (без конфликтов) Если признаков и видов много, а эволюции нет, то конфликты - норма Иерархичность

хорда => инвертир. глаза => челюсти => 4 ноги и легкие => амнион => шерсть и молоко бедные иерархии: птицы – клювы, нет зубов, перья, нет молока, эритроциты с ядрами, правая дуга аорты; млекопит. – наоборот. морские млекопитающие – только хищники и копытные Примеры иерархического распределения

Исаев Определитель жесткокрылых Среднего Поволжья 2002

Nikaido et al. PNAS 1999

Galili and Swanson PNAS 1991

К след. лекции: (на сайте)