КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Альтернативный сплайсинг – детская площадка эволюции М.Гельфанд Институт проблем передачи информации им. А.А.Харкевича РАН «Молекулярная и клеточная биология»,
Advertisements

Сравнительный анализ последовательностей ДНК БиБи 4 курс Осень 2005.
Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров.
Презентацию подготовила: Кабардова А.М. 2 курс. 1 гр.
Лекция 7 Володина Наталья. Процессинг РНК Сплайсинг Добавление СAP, poly A Альтернативный сплайсинг Процессинг тРНК и рРНК Рибозимы Деградация РНК.
TASK 1 Write words for the things in the picture in the correct part of the table. [ ]
ТЕОРИЯ ГЕНА. Электронная микрофотография вириовов фага Т4 ( слева схематическое изображение фага Т4.
Введение в эволюционную и медицинскую геномику, часть II ФББ МГУ, весна 2008.
Сравнительная геномика регуляторных и метаболических систем М. Гельфанд ИППИ РАН Отчетная конференция программы «Моекулярная и клеточная биология» Апрель.
PetroGen Bioinformatics Ltd. Versuche über Pflanzen-Hybriden (1865) von Gregor Mendel. Gregor Johann Mendel, PetroGen Bioinformatics Ltd.
Процессинг рРНК у прокариот А схема типичных единиц транскрипции рРНК Е. cоli. Между кодирующими участками для 16S, 23S и 5S рРНК и тРНК расположены спейсерные.
Быстрые пути эволюции белков. Эволюционный домен. БД PFAM.
The Images Of Russia.
Метаболические пути. БД KEGG. Метаболический путь – сеть ферментативных реакций, таких, что продукт одной реакции является субстратом другой. Принято.
Фрагмент кристаллической решетки примесных полупроводников Физика.
SABA – St. Petersburg (Statistics and) Algorithms in Bioinformatics Analysis ( Синдром Ангельмана Курбацкий Евгений Николаев Павел Чернятчик.
Процессинг РНК. Процессинг рРНК и тРНК в клетках бактерий.
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ СРЕДНЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ «КРАСНОЯРСКИЙ МЕДИКО-ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИЙ КОЛЛЕДЖ ФЕДЕРАЛЬНОГО.
МОТИВЫ ДНК. ЧТО ЭТО ТАКОЕ? Шкурат Татьяна Павловна.
Тема: Молекулярная биология гена. План лекции: 1.Ген – определение, классификация. 2.Понятие о мутоне, реконе, цистроне. 3.Строение гена у про- и эукариот.
Транксрипт:

КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (ГосНИИгенетика)

GENE organism 1 organism 2

GENE organism 1 organism 2

GENE exon 1exon 2 … exon 4 exon 3exon m-1exon m События в ортологичном гене : 1.консервация экзона 2.интронная вставка в экзон 3.делеция интрона 4.делеция экзона

isoform 1 isoform 2 GENE Классификация альтернатив 1. удержанный интрон

isoform 1 isoform 2 GENE 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон

isoform 1 isoform 2 GENE 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт

GENE isoform 1 isoform 2 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон

GENE isoform 1 isoform 2 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон 5. чередующийся экзон 1. внутренний Классификация экзонов и кодирующих сегментов 3. внешний isoform 1 isoform 2

coding segment 1 coding segment 2 … coding segment n-1 coding segment 3 coding segment n coding segment 4 isoform 1 isoform 2 isoform 3 isoform 4 GENE exon 1exon 2 … exon 4exon 3exon m-1exon m isoform 1isoform 2 … isoform k-1 isoform k coding segment 1 coding segment 2 coding segment 3 coding segment 4 coding segment 5 coding segment 6

Dme, Dps Aga

Dme, Dps Aga

Dps Aga Dme

Dme, Dps Aga stop (combined with acceptor site)

Dme, Dps Agaiiiiiiiv

Evolution of the exon-intron structure and alternative splicing in fruit flies and malarial mosquito genomes D.B.Malko, V.J.Makeev, A.A.Mironov, M.S.Gelfand Genome Research, 2006 Apr;16(4): Epub 2006 Mar 6.