КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (ГосНИИгенетика)
GENE organism 1 organism 2
GENE organism 1 organism 2
GENE exon 1exon 2 … exon 4 exon 3exon m-1exon m События в ортологичном гене : 1.консервация экзона 2.интронная вставка в экзон 3.делеция интрона 4.делеция экзона
isoform 1 isoform 2 GENE Классификация альтернатив 1. удержанный интрон
isoform 1 isoform 2 GENE 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон
isoform 1 isoform 2 GENE 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт
GENE isoform 1 isoform 2 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон
GENE isoform 1 isoform 2 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон 5. чередующийся экзон 1. внутренний Классификация экзонов и кодирующих сегментов 3. внешний isoform 1 isoform 2
coding segment 1 coding segment 2 … coding segment n-1 coding segment 3 coding segment n coding segment 4 isoform 1 isoform 2 isoform 3 isoform 4 GENE exon 1exon 2 … exon 4exon 3exon m-1exon m isoform 1isoform 2 … isoform k-1 isoform k coding segment 1 coding segment 2 coding segment 3 coding segment 4 coding segment 5 coding segment 6
Dme, Dps Aga
Dme, Dps Aga
Dps Aga Dme
Dme, Dps Aga stop (combined with acceptor site)
Dme, Dps Agaiiiiiiiv
Evolution of the exon-intron structure and alternative splicing in fruit flies and malarial mosquito genomes D.B.Malko, V.J.Makeev, A.A.Mironov, M.S.Gelfand Genome Research, 2006 Apr;16(4): Epub 2006 Mar 6.