А.Б. Рахманинова (13 апреля 2010 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспортные белки.
АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор
Объекты
-баррель -спирали
V.W.X.Y.Z
В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков белки с хотя бы одной трансмембранной спиралью Всего белковых структур. Мембранных (0.36% ), 2009
В чем проблема?
von Heijne the positive-inside rule
К ак оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?
Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она соответствует действительности. Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не верна. Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.
Сравнение нескольких предсказаний ROC-кривые (Receiver operating characteristic) или кривые ошибок