Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 1 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 1 Tough Protein Enhancer 1 Научный руководитель: Галинский Виталий Александрович, Преподаватель информатики и программирования ФМЛ 30 Косуха Анатолий 10-1 класс Логачев Федор 10-3 класс

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 2 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 2 Tough Protein Enhancer Составные части проекта Загрузка данных из файла формата Protein Data Bank Обработка информации Реализация докинга Визуализация, оконная система

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 3 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 3 Tough Protein Enhancer Общий ход работы

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 4 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 4 Tough Protein Enhancer Формат хранения протеинов Формат Protein Data Bank : Достоинства: - Существование больших баз протеинов - Большое распространение Недостатки: - Большой объем памяти компьютера - Отсутствие некоторых данных - Наличие множества версий формата Формат TPE: - Отсутствие недостатков формата PDB

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 5 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 5 Tough Protein Enhancer Формат хранения протеинов

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 6 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 6 Tough Protein Enhancer Реализация докинга Первый этап – случайное расположение молекулы лиганда(таблетки) на поверхности биомишени(протеина). Второй этап – расчет потенциальной энергии взаимодействия комплекса. Цель – минимизировать энергию взаимодействия.

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 7 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 7 Tough Protein Enhancer Расчет энергии взаимодействия Энергия электростатического взаимодействия Энергия Ван-дер-Ваальса Лиганд Биомишень

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 8 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 8 Tough Protein Enhancer Генетический алгоритм Размер ячейки Вершина решетки Пробный атом Сложность алгоритма:

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 9 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 9 Tough Protein Enhancer Визуализация Система вывода Система примитивов Система освещения Текстурный менеджер Система вывода прозрачных объектов Низкий уровеньОконная система Высокий уровень – взаимодействие с пользователем

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 10 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 10 Tough Protein Enhancer Визуализация Примеры примитивов

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 11 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 11 Tough Protein Enhancer Визуализация Оконная система

Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 12 Физико-математический лицей 30 Computer Graphics Support Group of 30 Phys – Math Lyceum 12 Tough Protein Enhancer Выводы и перспективы Реализован оригинальный формат, который обладает значительными преимуществами по сравнению с PDB Реализована система визуализации протеинов Реализована быстродействующая система докинга Перспективы: Выводы: Оптимальный алгоритм докинга на базе генетических алгоритмов Учет других видов энергии взаимодействия молекул Улучшение системы визуализации