LOGO Секвенирование ДНК с ипользованием нанопор Работу выполнила Студентка группы СП 2 ЛОГ Батченко Анастасия Проверила Цвирко Н.И.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Изучить клетку, ее значение и свойства. Изучить клетку, ее значение и свойства. Изучить органоиды клетки: Изучить органоиды клетки: Мембрана Мембрана.
Advertisements

Цели: Познакомиться с разнообразием вирусов. Узнать о строении и особенностях жизненного цикла вирусов. Изучить значение вирусов.
Лекция 2 1.Основные свойства вирусов 2.Организация вирусов.
Название предмета: Химия поверхностных явлений, адсорбции и наносистем (ХПЯАиН) Лекция 4 Методы исследования наночастиц и наносистем Преподаватель: Гайнанова.
«Нуклеин» - от лат. Nucleos – ядро. Открыты во второй половине ХIХ века швейцарским биохимиком Ф.Мишером. - высокомолекулярные соединения, выполняющие.
Разработала: учитель биологии высшей категории МОУ СОШ 1 Жабина М.В.
Открытие нуклеиновых кислот. В 1868 году швейцарский врач и биохимик Иоганн Фридрих Мишер выделил из ядер погибших лейкоцитов вещество, обладающее кислыми.
Нуклеиновые кислоты: структура и функции. Доказательства генетической роли ДНК Открытие нуклеиновых кислот – Ф. Мишер, Трансформация бактерий –
Лекция на тему: «Вирусы» Материал для подготовки к ЕГЭ.
Белки, нуклеиновые кислоты, полисахариды. Биополимеры класс полимеров, встречающихся в природе в естественном виде, входящие в состав живых организмов:
Приложение к лекции на тему: «Вирусы». 12 февраля 1982 г. является официальной датой рождения науки – вирусологии. Вирусы – это особое царство ультрамикроскопических.
Внутри каждой клетки, в ее ядре, находится некий «аппарат управления», который не только руководит текущими процессами в клетке, но и влияет на весь организм.
Лекция 1. Нуклеиновые кислоты: структура и функции Мяндина Галина Ивановна, д.б.н., профессор.
Презентация к уроку по биологии (10 класс) по теме: Презентация к уроку "Вирусы и бактериофаги"
ЯДРО 1 - Ядерная оболочка 2 - ядерные поры 3 - Ядерная плазма 4 - Ядрышко Хроматин Строение ядра.
1892 г. русский ученый Д. И. Ивановский открыл вирус табачной мозаики Вирус в переводе с латинского virus означает яд.
Наследственная информация записана в молекулах нуклеиновых кислот в виде последовательности нуклеотидов. Определенные участки молекулы ДНК и РНК ( у вирусов.
Вирусы – неклеточная форма жизни. Особенности строения и жизнедеятельности вирусов.
Тема 5 Строение животной клетки. Органоиды и части клетки Органоиды и части клетки (мембранные и немембранные компоненты). *Органоидами или органеллами.
Транксрипт:

LOGO Секвенирование ДНК с использованием нанопор Работу выполнила Студентка группы СП2ЛОГ Батченко Анастасия Проверила Цвирко Н.И

Нанопоровое секвенирование Нанопоровое секвенирование семейство высокоэффективных методов определения последовательности молекул ДНК или РНК с использованием белковых или твердотельных пор диаметром в несколько нанометров.высокоэффективных определения последовательностиДНКРНК

Нанопора альфа-гемолизина в мембране, напряжение отсутствует История

Под действием приложенного напряжения возникает ток ионов

При прохождении большой молекулы через пору (показана красным) ток ионов уменьшается

Принцип работы Нанопоровые системы представляют собой реакционную камеру, внутри которой находится раствор электролита. Камера разделена на две части липидной мембраной или иной тонкой непроводящей поверхностью, в которую внедрена единичная нано пора. К частям камеры прикладывают напряжение, из-за чего возникает ток ионов через пору. Когда исследуемые молекулы проходят через пору по направлению поля, они уменьшают сечение, доступное для ионов, и сила тока падает. Анализируя изменение силы тока, можно определить свойства молекулы, проходящей через пору.напряжениеток ионов В случае нуклеиновых кислот, диаметр используемых нанопор составляет несколько нанометров, из-за чего ДНК и РНК способны проходить сквозь пору только в одноцепочечной форме, но не в двухцепочечной. При прохождении молекулы нуклеиновой кислоты через пору отдельные нуклеотиды задерживаются в определенных сайтах внутри поры, в результате чего происходит измеримое падение силы тока.двухцепочечнойнуклеотиды

Достоинства По сравнению с уже существующими методами секвенирования применение нанопор обладает следующими преимуществами [7] : [7] Дешевизна и простота использования, достигается отсутствием необходимости приготовления образца и использования реактивов; Высокая чувствительность, вплоть до секвенирования без амплификации ДНК из крови или слюны;амплификации Высокая длина прочтений, вплоть до десятков тысяч оснований.

Типы нанопор Белковые нанопоры Альфа-гемолизин Альфа-гемолизин Staphylococcus aureus нано пора, гептамерный белок, состоящий из двух доменов: ствола и головки поры. Головка поры содержит полость диаметром около 4,5 нм. В месте соединения ствола и головки находится сужение канала шириной 1,4 нм. Ствол поры состоит из 14 антипараллельных бета-тяжей, формирующих сквозной канал шириной около 2 нм. Внутри ствола находится три сайта распознавания, на которых задерживаются проходящие молекулы. Время пребывания разных нуклеотидов на этих сайтах разнится, что и позволяет отличать одни основания от других.доменов MspA Порин A Mycobacterium smegmatis нано пора, диаметром 1,2 нм. Обладает структурными особенностями, которые улучшают соотношение сигнал/шум при секвенировании ДНК по сравнению с альфа-гемолизином. Моторный белок упаковки ДНК бактериофага phi29 В отличие от других пор данный белок в своей исходной форме не встраивается в мембрану, поэтому для его внедрения были использованы методы белковой инженерии. Ключевым отличием от вышеупомянутых белков является то, что имея больший диаметр канала, он способен пропускать двухцепочечную ДНК. Твердотельные нанопоры Помимо белковых нанопор также используются твердотельные нанопоры небиологической природы. Для анализа нуклеиновых кислот используют нанопоры в подложках из нитрида кремния и в монослоях графена. Их преимущества по сравнению с белковыми нано порами: большая стабильность, разнообразие форм и размеров пор, сравнительная простота в использовании. Недостатками является то, что твердотельные нанопоры не обладают атомарной точностью в своей форме и возможностями регуляции, присущими белкам.графена

Типы нанопор

LOGO