Выпускная работа по « Основам информационных технологий » Лисица Евгения Владимировна Руководитель : доцент Яцков Николай Николаевич Руководитель : доцент Кожич Павел Павлович Белорусский государственный университет Кафедра системного анализа Факультет радиофизики и электроники

Структура Актуальность Постановка целей и задач Постановка целей и задач Экспериментальные данные Экспериментальные данные Алгоритм сегментации ядер Алгоритм сегментации ядер Алгоритм сегментации клеток Алгоритм сегментации клеток Тестирование алгоритмов Тестирование алгоритмов Программный пакет CellAnalyser Программный пакет CellAnalyser Выводы Результаты

Актуальность ФУНКЦИИФУНКЦИИ ПРОТЕИНЫПРОТЕИНЫ Структура Цели и задачи Цели и задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Актуальность hνAhνA hνFhνF S0S0 S1S s s - 1 up to seconds photobleaching s -1 Структура Цели и задачи Цели и задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Постановка целей и задач Боковые проекции Зажатие клеток соседями Стеки клеток Структура Актуальность Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Сегментация ядер и цитоплазм клеток на люминесцентных изображениях биологических объектов Цели и задачи работы Задачи Структура Актуальность Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы 1. Сегментация ядер на изображении 2. Сегментация цитоплазм 3. Выполнить анализ алгоритмов с использованием имитационной модели 4. Выполнить анализ экспериментальных изображений 5. Разработка программного обеспечения

Экспериментальные данные Delta Vision Restoration Photometrix CH350L (500 kHz, 24-bit, 2048×2048 пикселей ) Nikon TE пикселей на 1 мкм DAPIER + Cy5 CK + Alexa Fluor 488 Красительλ погл нмλ исп нм Cy Alexa Fluor DAPI Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Сегментация ядер Начало работы Построение полутонового изображения Нахождение порогового значения Сглаживание полутонового изображения Разделение слившихся клеток Остановка Построение черно-белого изображения Сравнительный анализ методов сегментации биомедицинских изображений Е. В. Лисица 67-ая научной конференция студентов и магистрантов БГУ. Минск Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Клеток Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Сегментация клеток Начало работы Построение полутонового изображения Нахождение порогового значения Построение черно-белого изображения Сращивание маски ядер и маски цитоплазмы Разделение слившихся клеток Остановка Цифровая обработка люминесцентных изображений раковых клеток Е.В. Лисица, Н.Н. Яцков, В.В. Апанасович, Т.В. Апанасович «Научные стремления ».Минск,2010. Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Тестирование CellAnalyser Выводы Результаты

Тестирование алгоритмов Разработка моделей биомедицинских изображений. Лисица Е.В., Яцков Н.Н., Лутковский В.М. «Первый шаг в науку ». Минск Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток CellAnalyser Выводы Результаты

Сегментация экспериментальных изображений Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток CellAnalyser Выводы Результаты

CellAnalyser. Интерфейс. Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование Выводы Результаты

CellAnalyser. Выходные данные. Маски Опухоли Ядер Клеток Файлы с дифференциальными характеристиками Ядер клеток Файл с интегральной характеристикой Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование Выводы Результаты

Выводы Сегментация ядер и клеток Устойчивость при воздействии шумов Применимы к экспериментальным изображениям Количество пропущенных и раздробленных ядер меньше 5% Программный пакет CellAnalyser Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyse Результаты

Результаты Международная научно - техническая конференция « Медэлектроника -2010». Минск Республиканская молодёжная конференция с международным участием « Научные стремления ». Диплом 2- ой степени. Минск Научная конференция студентов и магистрантов БГУ. Минск Международная научно - практическая конференция « Информационные технологии, электронные приборы и системы -2010». Минск Международный студенческий форум « Первый шаг в науку -2010». Диплом 3- ей степени. Минск Структура Актуальность Цели и Задачи Цели и Задачи Эксперимент Сегментация Ядер Клеток Тестирование CellAnalyse Выводы

Спасибо за внимание ! Актуальность Постановка целей и задач Постановка целей и задач Экспериментальные данные Экспериментальные данные Алгоритм сегментации ядер Алгоритм сегментации ядер Алгоритм сегментации клеток Алгоритм сегментации клеток Тестирование алгоритмов Тестирование алгоритмов Программный пакет CellAnalyser Программный пакет CellAnalyser Выводы Результаты