Создан постановлением Правительства РФ 25 мая 1994 года на базе охотничьего заказника республиканского значения. Общая площадь его территории составляет гектар. Кроме того, заповедник имеет охранную зону общей площадью около 81 тысячи гектаров. Заповедник находится в Советско-Гаванском районе Хабаровского края. Его территория расположена в бассейне реки Ботчи, в 120 км от города Совгавань.

Северная граница заповедника проходит по водоразделу бассейна рек Мульпа и Топты и водоразделу между левыми притоками реки Ботчи и правыми притоками реки Коппи. Западная граница проходит по водораздельному хребту между реками Бо-Джауса и Ботчи, по западной административной границе Совгаванского района до водораздела между реками Уйна и Неу. Южная граница - по водоразделу между правыми притоками реки Ботчи и левыми притоками реки Нельма и далее по хребту Туманный. Восточная граница проходит вдоль границы водозащитной лесной полосы на расстоянии около 10 км от побережья Татарского пролива. Река Ботчи

Территория заповедника представляет собой экосистему, подверженную наименьшему воздействию антропогенного фактора. Уникален тем, что бассейн реки Ботчи является естественной границей между южной маньчжурской и северной охотской тайгой, причём с явным преобладанием последней. Вследствие этого, на данной территории наблюдается смешение флор и фаун, характерных для обеих географических зон и высокое видовое разнообразие. Из данных, которыми мы располагаем, известно, что на территории заповедника предположительно обитает около 200 видов птиц, из них 16 видов занесены в Красную книгу РФ

Ботчинский заповедник находится на территории, где сошлись и совместно существуют обитатели севера и юга. Именно здесь проявляется особая зоогеография: житель севера - рябчик, соседствует со сказочной уткой-мандаринкой, которая стала эмблемой «Ботчинского заповедника». На территории заповедника обитает черный журавль, египетская и белокрылая цапля, рыбный филин, орлан- белохвост, утка-мандаринка, дикуша. Всего на территории заповедника обитает 164 вида птиц, 40 видов млекопитающих. Именно со времен доледниковая сохранились в нашем крае реликтовые млекопитающие: амурский тигр, харза. Вместе с холодом к нам пришли животные севера: рысь, бурый медведь, росомаха, соболь, горностай. Чистые богатые рыбой реки Ботчи и Мульпа, в которых водится кета, таймень, горбуша, хорошая кормовая база для птиц, бурого медведя, выдры. Большое количество копытных – изюбрь, лось, кабан, косуля, кормовая база для хищных животных – тигра, волка.

В заповеднике обитает амурский тигр, встречаются редкие и реликтовые растения: венерины башмачки пятнистый и крупноцветковый, тис остроконечный, бадан тихоокеанский и др.